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玉米低磷胁迫SSH文库中重要基因的表白分析及PAPP基因的序列变异

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毕业论文范文题目：玉米低磷胁迫SSH文库中重要基因的表白分析及PAPP基因的序列变异，论文范文关键词：玉米低磷胁迫SSH文库中重要基因的表白分析及PAPP基因的序列变异
玉米低磷胁迫SSH文库中重要基因的表白分析及PAPP基因的序列变异毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：磷是动物的核酸、核蛋白、磷脂、三磷酸腺苷等的重要组成成分,也是动物成长过程中所必须的大量养分元素之一,在动物体的新陈代谢中发挥了重要的作用,然而动物重要接收无机磷,有机磷必须转化为无机磷才干被接收利用,而泥土中80%的磷都是不可挪动,因此不能被动物接收。为了满意作物的畸形成长,人们常用的方法就是采取追加磷肥的方法以保障作物的畸形成长跟发育,而寰球的磷矿石资源在本世纪却面临消散殆尽,对作物进行耐低磷育种显得非常急切。玉米是我国种植面积第一,总产为第二的重要粮食作物。因此研究玉米耐低磷分子机制,并鉴定低磷胁迫应答相干基因的功能,对培养耐低磷玉米品种存在重要的实际参考跟实际意思。本实验在前期已构建的玉米根系低磷胁迫SSH文库的研究基本之上,结合EST的测序跟同源比对分析,选取PAPP(Purpleacidphosphataseprecursor)、PAP(Purpleacidphosphatase)、AP(Auxin-inducibleprotein)、APY(Apyrase)、CIPK(CalcineurinB-likeproteini（略..）nteractingproteinkinase)、AAPT(Aminoalcohol-Phosphotransferase)、STPK(Serine/threoninekinaseprotein)7个基因,分辨代表磷素轮回跟信号转导两类基因,作为本研究的目标基因。采取实时荧光定量PCR方法,比较分析了7个候选基因在自交系178、9782的根跟叶在低磷与对比处理下的表白模式。同时,还侧重分析PAPP基因在14个玉米自交系中的SNP变异跟长度多态性,重要研究成果如下：1、在低磷胁迫下,PAPP基因的表白程度在根中的总体变更比叶中的变更更明显,低磷处理72h时,该基因在两个供试材料的根中一致性的下调表白,而在叶中呈上调表白。该基因在178中呈明显的前期引诱上调表白,特别是在根中存在较明显的引诱表白效应,且在24h表白量达到最高。在9782中呈明显的前期引诱下调表白。生物信息学分析表明,该基因编码457个氨基酸序列,存在一个蛋白质跨膜构造且与蓖麻的PAPP基因属于同一个进化分支。PAP基因编码349个氨基酸,存在一个跨膜构造,与拟南芥的PAP4跟PAP17同在一个进化分支上。该基因表白的最（此处忽略..）大法则是在72h时在叶中呈较明显的上调表白,在根中呈下调表白,且在两个供试材料中存在一致性。且在根中12h表白量达到最高,在叶中72h表白量达到最高。AP基因编码105个氨基酸,猜测成果显示存在2个跨膜构造有。AP基因的表白分析显示：根中的表白量高于叶片,表明该基因存在组织表白差别特点,重要集中在根中表白。对APY基因,它编码176个氨基酸,通过猜测它不属于跨膜蛋白,与菜豆的APY、野苔荬APY、苜蓿APY2同属于一个进化分支。该基因的表白量在根中总体高于叶片,其表白的最大特点是在9782的叶片中各个时段均未检测到该基因的表白,值得进一步验证跟探讨。该基因在178的根跟叶中6h跟72h表白量趋于一致。CIPK基因编码449个氨基酸,而且蛋白质不跨膜构造存在。进化树分析表明该基因与蓖麻的SbCIPK27跟SbCIPK28同在一个进化分支上。分析该基因的表白模式显示,在处理后有一个24h时光点处明显的下调表白法则,这个基因在低磷胁迫下的分子特点须要进一步研究。AAPT基因编码757个氨基酸,通过在线猜测,存在8个跨膜构造；进化树分析表明该基因与高粱的AAPT同在一个进化分支上。定量成果（略..）显示：在前期处理12h时,表白量达到最高,且在根中浮现出明显的上调表白,后期的引诱表白变更不明显。该基因在叶中的表白量的变更幅度也不明显。STPK基因编码341个氨基酸,而且该蛋白质不跨膜构造存在。该基因的表白分析表明：在低磷胁迫12h时,表白量达到最高,在根中浮现出明显的上调表白,在叶中下调表白。在72h时,该基因在叶中的表白量达到最高。2、通过Maizegdb在线分析PAPP基因序列,该基因在玉米中以单拷贝情势存在,并且由5个外显子跟4个内含子组成。在第二个外显子区域(1370nt-1589nt)筛选出多态性引物ppl,能在14个自交系[(CML-473)-B、Cheng698、B73、Dan599、Chang7-2.S37.Dan598.975-12.获唐黄、RP125、18-599、R08、178、9782]扩增出长度多态性差别片段,进一步将14个自交系的PAPP基因片段序列在CLUSTALW进行在线多序列的比对分析,将14个自交系分为两类,分辨是由Cheng698.Dan599.Chang7-2、S37、975-12、获唐黄、R08、178组成的8个自交系跟由(CML-473)-B、B73、Dan598、RP125、18-599、9782组成6个自交系,它们的条带分辨一致,而且扩增出的片段比较保守。一共发明2个Indel跟5个（略..）SNP位点,其中2个Indel分辨由7个核苷酸跟5个核苷酸组成,并且都在该基因的非编码区域,多态性变异达到cDNA序列的7.76%。SNP渐变位点分辨是获唐黄的1394nt由C渐变成T,且为非同义渐变,氨基酸由丙氨酸(Ala)渐变成缬氨酸(Val),同时在1471nt由T渐变成C,S37跟178在1395nt处由A渐变成G,Chang7-2在1458nt处由A渐变成T。值得留神的是,与178类似的8个自交系跟与9782类似的6个自交系比拟较,在序列的1541nt-1545nt之间有5个核苷酸(TGTTG)插入

以上为本篇毕业论文范文玉米低磷胁迫SSH文库中重要基因的表白分析及PAPP基因的序列变异的介绍部分。

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