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我国鳑鮍亚科鱼类遗传多样性及系统发育研究

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毕业论文范文题目:我国鳑鮍亚科鱼类遗传多样性及系统发育研究,论文范文关键词:我国鳑鮍亚科鱼类遗传多样性及系统发育研究
我国鳑鮍亚科鱼类遗传多样性及系统发育研究毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:本研究利用ISSR和线粒体Cytb基因作为分子标记,分别对中华鳑鮍、高体鳑鮍和斑条刺鳑鮍3个种群遗传多样性和我国鳑鮍亚科的系统发育进行了分析。遗传多样性运用Popgene软件,对其遗传多样性参数进行分析;系统发育运用MEGA4.0软件,分别采用NJ法、MP法和ME法重建鳑鮍亚科鱼类的分子系统发育树。主要研究结果如下:(1)利用ISSR标记技术,分别分析了中华鳑鮍、高体鳑鲏和斑条刺鳑鮍3个自然群体内的遗传多样性及群体间的差异。利用10个ISSR引物对3个群体共150个个体的基因组DNA进行PCR扩增,共检测到90个重复性好且谱带清晰的位点(略..),片段大小在200-2000bp之间,其中多态位点51个,多态性比例为56.67%。利用Popgene软件分析3个鳑鮍群体内的多态位点比例(PPB)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样度(h)、Shannon’s信息指数(I)和遗传距离(D)分别在51.14%-53.93%、1.3229-1.4375、1.1877-1.2446、0.1081-0.1435、0.2163~0.1616、0.0652~0.0923之间,各群体所有遗传多样性指标综合显示,3个群体的遗传多样性水平均较高,依次为:斑条刺鳑鮍高体鳑鲏中华鳑鮍。基于Nei’s基因多样性计算鳑鮍群体间遗传分化系数Gst为0.3519,说明有35.19%的遗传变异来源于群体间,有64.81%来源于群体内,由Gst计算的种群间基(本文此处忽略..)因流(Nm)为0.9209,说明基因流水平低。根据Nei的公式计算群体间的无偏遗传距离(D),结果显示,中华鳑鮍群体与高体鳑鲏群体遗传距离最小(0.1332),高体鳑鮍群体和斑条刺鳑鮍群体的遗传距离最大(0.1860)。NJ聚类显示,中华鳑鮍群体和高体鳑鲏群体间的亲缘关系最近,最先聚在一起,然后与斑条刺鳑鮍群体聚在一起。(2)通过PCR扩增、测序等方法获得了中华鳑鮍和高体鳑鲏的线粒体DNACytb基因全序列(1141bp),并从GenBank中下载的鳑鮍亚科鱊属4种鱼的细胞色素b基因序列(1140bp),在同源的1140bpCytb基因序列中,没有发现碱基的插入和缺失,其中T、C、A和G碱基(本文此处忽略..)平均含量分别为30.1%、26.7%、28.2%、15.0%,显示G碱基相对缺乏,其中A+T的含量(58.3%)高于G+C的含量(41.7%),在三联密码子中碱基组成有很大的变化,在密码子的第一位中四种碱基频率相近,但第二位中T碱基的频率高达41.2%,在第三位中,A碱基的频率达到39.9%,但G碱基只有5.9%,表现出很明显的碱基偏倚。转换与颠换的比值为2.5,序列中的转换明显多于颠换,说明这些序列没有达到突变饱和。3种聚类方法构建的分子系统树的拓扑结构基本一致,将大鳍鱊、短须鱊、越南鱊与中华鳑鮍和高体鳑鮍聚在一起,兴凯鱊与外类群聚为一支。两种分子标记进行聚类都显示出中华鳑鮍与高体鳑鮍聚(文章此处忽略..)在一起,且遗传距离较近,表明其亲缘关系较近。本研究支持林人端的观点,中华鳑鮍是高体鳑鮍的同物异名。


以上为本篇毕业论文范文我国鳑鮍亚科鱼类遗传多样性及系统发育研究的介绍部分。
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