基于线粒体COI基因和微卫星标记对细鳞鲴种群遗传结构的研究

搜索高级搜索

原创毕业论文

基于线粒体COI基因和微卫星标记对细鳞鲴种群遗传结构的研究

作者: 浏览:5次

免费专业论文
政治工作论文
计算机论文
营销专业论文
工程管理论文范文
医药医学论文范文
法律论文范文
生物专业论文
物理教学论文范文
人力资源论文范文
化学教学论文范文
电子专业论文范文
历史专业论文
电气工程论文
社会学专业论文
英语专业论文
行政管理论文范文
语文专业论文
电子商务论文范文
焊工钳工技师论文
社科文学论文
教育论文范文
数学论文范文
物流论文范文
建筑专业论文
食品专业论文
财务管理论文范文
工商管理论文范文
会计专业论文范文
专业论文格式
化工材料专业论文
英语教学专业论文
电子通信论文范文
旅游管理论文范文
环境科学专业论文
经济论文
人力资源论文范文
营销专业论文范文
财务管理论文范文
物流论文范文
财务会计论文范文
数学教育论文范文
数学与应用数学论文
电子商务论文范文
法律专业论文范文
工商管理论文范文
汉语言文学论文
计算机专业论文
教育管理论文范文
现代教育技术论文
小学教育论文范文
机械模具专业论文
报告,总结,申请书
心理学论文范文
学前教育论文范文

收费计算机专业论文范文

收费计算机专业论文
Delphi
ASP
VB
JSP
ASP.NET
VB.NET
java
VC
pb
VS
dreamweaver
c#.net
vf
VC++
计算机论文

毕业论文范文题目：基于线粒体COI基因和微卫星标记对细鳞鲴种群遗传结构的研究，论文范文关键词：基于线粒体COI基因和微卫星标记对细鳞鲴种群遗传结构的研究
基于线粒体COI基因和微卫星标记对细鳞鲴种群遗传结构的研究毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：细鳞鲴(Xenocyprismicrolepis)隶属于鲤形目,鲤科,鲴属,在我国大多数江河湖泊中均有分布。本论文通过对基因组DNA进行扩增得到细鳞鲴线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(CytochromeoxidasesubunitI,COI)基因序列全长,然后利用COI基因部分序列作为标记对钱塘江和曹娥江流域的细鳞鲴群体的遗传结构进行了初步的探讨,最后用ISSR—抑制PCR法筛选细鳞鲴微卫星位点,并用筛选出的微卫星位点对细鳞鲴群体进行了遗传多样性和遗传结构的分析,从分子水平上探讨了钱塘江和曹娥江的细鳞鲴群体间的遗传关系。1、细鳞鲴线粒体COI基因序列测定与分析首先根据GenBank数据库中几种鲴属鱼类的线粒体COI基因两端保守的tRNA序列区设计简并引物对基因组DNA进行扩增,PCR扩增产物纯化后测序,最后获得了COI基因1551bp大小的序列全长,起始密码子（本文此处忽略..）为GTG,终止密码子为TAA。通过BLAST进行同源性分析比对结果显示:细鳞鲴的线粒体COI基因与银鲴,黄尾鲴和圆吻鲴三种鲴属鱼类线粒体COI基因序列相似度分别为94%、94%和92%,具有较高的同源性。通过MEGA4.0进行遗传变异分析,并根据遗传距离构建系统发育树,四种鲴属鱼类的系统发育进化树采用邻接法(Neighbor-Joining,NJ),以青鱼的线粒体COI基因序列为外类群,基于Kimura双参数模型进行构建,系统发育树构建结果显示:银鲴和黄尾鲴聚为一支,然后与细鳞鲴聚为一支,而与圆吻鲴的关系相对较远。2、利用线粒体COI基因标记探讨细鳞鲴群体遗传结构根据获得的COI基因序列全长,用PrimerPrimier5.0软件在变异较大的区域设计引物扩增部分COI,设计的引物产物片段大小为560bp,上游引物位于COI基因510bp处,下游引物位于1070bp处。对钱塘江和曹娥江两流域七（此处忽略..）个地点的细鳞鲴群体131个样本基因组进行扩增后,PCR扩增产物纯化后直接进行双向测序,以增强测序结果的可靠性。将获得的序列片段用于遗传多样性和遗传结构分析,分析结果显示:七群体的单倍型多样性(h)分别为0.5000、0、0.1425、0.1287、0.3556、0.5330和0.1732,核苷酸多样性(π)分别为0.0009、0、0.0002、0.0002、0.0006、0.0010和0.0003,其中FS群体的多样性水平最高,另外六个群体多样性水平都较低;七个群体COI基因片段序列的A、T、G、C含量具有一定的偏倚性,A+T含量明显高于G+C含量;共有3个变异位点,分别发生在第45、264和395三个位点,产生4个单倍型,分别为hap1(FK1)、hap2(FK7)、hap3(LQ12)和hap4(FW26)。其中,除了JJZ只有一种单倍型外,其余六个群体都有两个单倍型。对所有单倍型做最小拓展网络(minimumspanningnetwork)分析表明,FK1是最主要、最原始的单倍型,其他的单倍型为拓展单倍型;AMOVA分析显示,群体（此处忽略..）间遗传变异占总变异的13%,群体内的遗传变异占总变异的87%,表明群体内变异是总变异的主要来源。3、细鳞鲴微卫星的筛选及多样性鉴定ISSR—抑制PCR法是一种简便快速的筛选微卫星位点的方法,它与常规的微卫星位点筛选的方法不同,不需要富集文库,由此节省了大量时间和花费。ISSR—抑制PCR法筛选微卫星是利用ISSR片段两端均含有SSR片段,从而有较强的针对性,对于缺乏引物序列信息的物种而言,是一条简便有效的途径。本实验利用此法设计了14对微卫星引物XI1~XI14,最终有5个位点具有多态性,分别为XI2、XI5、XI7、XI11和XI13,表明此法运用于鱼类微卫星标记的筛选是可行的。将5个位点的扩增统计结果用PopGen32软件进行计算分析,位点X13具有较高的观测杂合度和期望杂合度,分别为0.6559和0.7402;位点X11的观测杂合度和期望杂合度较低,分别为0.1398和0.1307。哈迪温伯格检验结果表明均不显著(P0.05),没有偏离（本文此处忽略..）哈迪温伯格平衡,不存在杂合子过剩状态,可以作为良好的微卫星标记。通过软件计算群体间Nei’s遗传距离和遗传一致性,每两个群体间的遗传一致性都趋近于1,说明群体间无明显分化;遗传距离在0.0500~0.1910之间,根据遗传距离通过UPGMA法构建系统树,FK、JJZ、LQ和FW四个群体聚为一支,SY和SD两个群体聚为一支,FS群体的距离相对较远,部分符合地理上的距离关系。

以上为本篇毕业论文范文基于线粒体COI基因和微卫星标记对细鳞鲴种群遗传结构的研究的介绍部分。

本论文在计算机论文栏目，由论文网(www.zjwd.net)整理,更多论文,请点论文范文查找

相关论文

收费专业论文
汉语言文学论文
物理学论文
自动化专业论文
测控技术专业论文
历史学专业论文
机械模具专业论文
金融专业论文
电子通信专业论文
材料科学专业论文
英语专业论文
会计专业论文
行政管理专业论文
财务管理专业论文
电子商务国贸专业
法律专业论文
教育技术学专业论文
物流专业论文
人力资源专业论文
生物工程专业论文
市场营销专业论文
土木工程专业论文
化学工程专业论文
文化产业管理论文
工商管理专业论文
护理专业论文
数学教育专业论文
数学与应用数学专业
心理学专业论文
信息管理专业论文
工程管理专业论文
工业工程专业论文
制药工程专业论文
电子机电信息论文
现代教育技术专业
新闻专业论文
艺术设计专业论文
采矿专业论文
环境工程专业论文
西班牙语专业论文
热能与动力设计论文
工程力学专业论文
酒店管理专业论文
安全管理专业论文
交通工程专业论文
体育教育专业论文
教育管理专业论文
日语专业论文
德语专业论文
理工科专业论文
轻化工程专业论文
社会工作专业论文
乡镇企业管理
给水排水专业
服装设计专业论文
电视制片管理专业
旅游管理专业论文
物业管理专业论文
信息管理专业论文
包装工程专业论文
印刷工程专业论文
动画专业论文
环境艺术专业论文
信息计算科学专业
物流专业论文范文
人力资源论文范文
营销专业论文范文
工商管理论文范文
汉语言文学论文范文
法律专业论文范文
教育管理论文范文
小学教育论文范文
学前教育论文范文
财务会计论文范文

电子商务论文范文

上一篇：外周血TLR4,hs-CRP与早产亚临床绒..

下一篇：丝裂霉素C及地塞米松对抑制LASEK..