空肠弯曲菌铁相关受体基因序列的分析研究

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空肠弯曲菌铁相关受体基因序列的分析研究

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毕业论文范文题目：空肠弯曲菌铁相关受体基因序列的分析研究，论文范文关键词：空肠弯曲菌铁相关受体基因序列的分析研究
空肠弯曲菌铁相关受体基因序列的分析研究毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：目的:通过比对空肠弯曲菌(Campylobacterjejuni,C.jejuni)的CfrA,ferricenterobactieceptor,铁吸收相关受体的基因序列,分析CfrA序列核酸及氨基酸序列特征,了解CfrA基因的突变碱基,蛋白质二级结构,疏水性特点,推测可能存在的高变异区段,同时分析其遗传进化关系,为C.jejuni疫苗研究提供基础资料。方法:选取分离自河北医科大学附属第二医院神经内科临床确诊感染C.jejuni的患者粪便并且已经由动物模型证实为致吉兰-巴雷综合征的3株C.jejuni它们分别为zhanxingstrain,,luleistrain,qiaoyuntaostrain,以及选取来自NCBI的G（略..）eneBank中12株的已经测定CfrA的空场弯曲菌CfrA的基因序列。将本地三株C.jejuni菌株进行细菌复苏,培养,提取基因组DNA并测序。应用SequenceAlignment生物信息学软件,将得到的全基因组序列与Genbank中NCTC11168序列对照进行比对,了解CfrA基因的突变碱基。应用DNAstarProtean软件对其编码的蛋白质结构进行对比分析,了解CfrA基因的蛋白质二级结构、疏水性特点。应用MegAlign软件,计算序列间的遗传距离。将得到的12株C.jejuni菌株的CfrA基因序列根据遗传树分组,应用DNASTAREditseq,MegAlign等生物信息学软件对CfrA基因序列进行组间的比较,推测可能（文章此处忽略..）存在的高变异区段。应用DNAstarProtean软件对其编码的蛋白质结构进行对比分析,了解CfrA二级结构、疏水性特点。并分析其遗传进化关系.结果:本地zhanxingstrain,luleistrain,qiaoyuntaostrain的CfrA基因均由2091个碱基构成,与NCTC11168的cfra基因序列相比,突变率分别为0%;1.4%;1.3%。疏水性无明显变化。遗传距离计算最大为zhanxing株与lulei株距离为1.6%。来自NCBI十二株空肠弯曲杆菌cfra基因中(1)C.jejunisubsp.jejuni84-25gcj8425_13(2)C.jejunisubsp.jejuni260.94c_jejuni_subsp_jejuni_26094_40(3)C.jejunisubsp.doyle（此处忽略..）i269.97(4)C.jejunisubsp.jejuniCG8421C493四株存在插入与缺失。余序列均由2091个碱基构成,最高变异率为6.79%.碱基高变异的区段分别为,第一组有高度相似性,高变异区段为6-147,第二组变异率较高,变异区段1-1008保守区段在1059-2075,第三组高变异;蛋白质二级结构,第1组5-54位,524-692位区段二级结构有变异。第2组1-24位区段520-692位区段二级结构有变异。各个区段位于表面的可能性均较小。疏水性均无明显变化。遗传距离计算最大为S3B株与M76297株距离为5.5%。结论:15株菌株除四株外均显示较高的保守性。对它们的序列同源性进行了对比,表明Cfra基因的同一性的水平波动在93%-100%。zhanxingstrain,luleistrain,qiaoyuntaostrain遗传距离较小,可能反映了河（本文此处忽略..）北地区空肠弯曲菌在进化上存在一定的聚类现象,推测具有的区域特征。第三组菌株的高变异情况,推测空肠弯曲菌铁摄取系统的表面受体基因可能不是单一的,而是多个基因共同作用的结果;或者,菌株可能含有同源性铁调节外膜蛋白,总之本研究中的15株菌株的序列对比的情况为建立研究华北地区菌株的地域性特点及对空肠弯曲菌感染的监测及疫苗的制备奠定了基础。

以上为本篇毕业论文范文空肠弯曲菌铁相关受体基因序列的分析研究的介绍部分。

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