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家蚕核rDNA的克隆及其分子系统发育分析

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毕业论文范文题目：家蚕核rDNA的克隆及其分子系统发育分析，论文范文关键词：家蚕核rDNA的克隆及其分子系统发育分析
家蚕核rDNA的克隆及其分子系统发育分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：本研究以家蚕为材料,使用SES、SDS、KI、CTAB法提取家蚕的基因组DNA,紫外和琼脂糖凝胶电泳表明:SES法提取家蚕丝腺DNA简便、快捷,提取的DNA质量较高。以其他昆虫的rDNA的保守序列为参考设计了多对特异引物,分段克隆并测序家蚕rDNA的全序列和柞蚕18SrDNA。测序结果拼接后表明家蚕18SrDNA为1907bp、ITS1为762bp、5.8S为167bp、ITS2为878bp、28SrDNA则长达3981bp,家蚕rDNA总长度为7695bp。将家蚕18SrDNA、柞蚕18Sr（略..）DNA与从GenBank中检索出的14个目18种昆虫的18SrDNA用Clustal1.83软件进行多序列比对,表明昆虫的18SrDNA有四段相对保守序列,在同源区各物种昆虫之间碱基差别不是很大,变异主要由转换和巅换引起,而在多变区则主要由插入、缺失引起。用系统发育软件PHYLIP3.63最大简约法和距离法以18SrDNA全序列及不同的同源区构建系统发育树,表明各种昆虫在分子系统发育树中的位置虽略有变化,但其关系基本一致:鳞翅目昆虫和双翅目昆虫首先在内部聚（略..）类后再相聚,两目昆虫之间的亲缘关系较近;等翅目与蜚蠊目关系较为接近;弹尾目、缨尾目关系较接近,与其他昆虫的亲缘关系较远;膜翅目分类地位多变说明膜翅目的18SrDNA进化较快;通过对这些系统发育树的比较,为形态分类学存在争论的将半翅目和同翅目并为一系、捻翅目自成一系提供了分子水平的证据。用18SrDNA不同的同源区所构建的系统发育树大致相同,表明18SrDNA的不同同源区在进化上有协同进化的现象,且在5'端和3'端则在进化上更为保守,同时结果（此处忽略..）表明18SrDNA是研究中等阶元以上的分子系统发育的有效标记分子。在ITS1序列内部存在明显的G、T结构:其中A占25.40%,T为30.30%;C为19.93%,G为24.37%,在进化过程中有碱基选择的偏好性;而ITS2的A占28.35%,T为31.50%;C为18.11%,G为22.05%,A、T碱基明显较多。通过用Clustal1.83的自举NJ法构建的系统发育树表明,ITS1比ITS2在进化上相对保守,ITS2在进化过程中变异较大,ITS1适合于中等阶元的系统发育研究,而ITS2则可用于近缘种内的系统发育研究;28SrD（本文此处忽略..）NA最长,碱基组成基本均衡,没有偏异现象。通过对家蚕rDNA的克隆与序列分析,表明家蚕rDNA不同区段进化速率明显不同,为rDNA在家蚕起源与进化、品种选育与鉴定等方面的研究提供了一定的基础。

以上为本篇毕业论文范文家蚕核rDNA的克隆及其分子系统发育分析的介绍部分。

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