人类pre-mRNA二级结构的数据库建立及与蛋白质相关性的分析

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人类pre-mRNA二级结构的数据库建立及与蛋白质相关性的分析

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毕业论文范文题目：人类pre-mRNA二级结构的数据库建立及与蛋白质相关性的分析，论文范文关键词：人类pre-mRNA二级结构的数据库建立及与蛋白质相关性的分析
人类pre-mRNA二级结构的数据库建立及与蛋白质相关性的分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：对RNA二级结构的研究是当今生物信息学一个非常重要的课题,并且长期的研究已经得到了很大的拓展和深入。相对于RNA一维线性结构而言,其单链自身回折形成二级结构和高级结构的多样性具有更多的生物学意义。因此要想深入探索RNA的复杂功能和特性,了解各类RNA在细胞中的运作机制,就要从研究RNA的具体结构入手。由于RNA分子具有难以纯化,难以结晶,降解速度快等特点,通过X射线晶体衍射以及NMR等实验手段去测定RNA分子的立体结构是（此处忽略..）一个困难的、缓慢的而又耗费大的过程。虽然测得的结果精确可靠,然而面对当前海量的生物序列,实验方法显然无法逐一测定。而借助于计算机和各种数学方法从理论上去预测RNA的空间结构,则可大大提高我们认识RNA空间结构的效率,为揭示RNA结构与功能的关系提供重要信息。RNA结构预测研究起步较早,1981年由Zuker提出的最小自由能算法,经过近三十多年的不断改进和发展,现已成为国际上广泛使用的RNA二级结构预测方法。本文利用Zuker的最（此处忽略..）小自由能算法,结合我们建立的动态延伸折叠方法对大量的人类pre-mRNA样本二级结构进行预测,并将结果以数据库形式存放。同时分析了这些mRNA二级结构和其编码的蛋白质二级结构之间的关系。本文主要有以下三部分内容和成果:1.建立pre-mRNA人类样本二级结构数据库。在GenBank数据库中采集到335个人类pre-mRNA样本,根据实验室之前提出动态延伸折叠方法编写相应的程序,使动态延伸折叠方法大部分工作得以完全程序化。利用程序（略..）生成pre-mRNA人类样本二级结构数据库,作为后续工作的基础,同时将数据库发布并托管于云南大学网络中心服务器(http://www.mbrc.ynu.edu.cn/Human_mRna_db.html),供广大科研工作者查询。2.建立mRNA与其编码蛋白质关系数据库。在数据库中寻找上一部分工作中的335个pre-mRNA人类样本所编码的蛋白质信息,并且编写程序将mRNA的序列,mRNA的二级结构,氨基酸的序列,蛋白质的二级结构这四（此处忽略..）项信息在位置上完全匹配对齐。最后按照特定的格式保存结果,以便后续的分析。3.通过分析和统计以上积累的数据,得出结论:规则的蛋白质二级结构所对应mRNA二级结构的m/n值往往较高,而不规则的蛋白质二级结构对应的则较低;mRNA二级结构中的配对区域的m/n值较高,而非配对区域的m/n值较低;mRNA中的配对区域更趋向于编码规则的蛋白质二级结构,而非配对区更趋向于编码不规则的蛋白质二级结构。

以上为本篇毕业论文范文人类pre-mRNA二级结构的数据库建立及与蛋白质相关性的分析的介绍部分。

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