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胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA克隆与组织表达研究

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毕业论文范文题目:胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA克隆与组织表达研究,论文范文关键词:胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA克隆与组织表达研究
胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA克隆与组织表达研究毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:α-淀粉酶以随机作用方式切断淀粉、糖原、寡聚或多聚糖分子内的α-1,4糖苷键,产生麦芽糖、低聚糖和葡萄糖等,是广泛应用于葡萄糖生产、啤酒酿造、酒精工业、发酵以及纺织等许多行业中的一种重要的工业用酶。胭脂鱼是我国特有珍稀鱼类,为国家二级保护动物,具有个体大、生长快、肉质鲜美、性情温驯、抗病力强等特点。鱼类α-淀粉酶是碳水化合物水解酶类的一种,肝胰脏是α-淀粉酶中心生成器官,它分泌机能的强弱直接影响鱼类对食物的消化能力。很多的实验都表明α-淀粉酶的合成过程并不是由摄食所诱导的,而是鱼类自身发育的一种生命现象,其酶的合成与日龄有关。目前,还没有从分子水平阐明胭脂鱼α-淀粉酶的结构。本研究对胭脂鱼α-淀粉酶mRNA进行了克隆和序列测定分析,并进一步探讨了α-淀粉酶在鱼体各组织中的表达情况,这使我们可以更清楚地了解鱼体是在何部位利用食物中相应成分的,也为研究α-(本文此处忽略..)淀粉酶的分泌、贮存机制提供了途径。主要研究结果如下:1.胭脂鱼α-淀粉酶基因的全长cDNA序列在对多种硬骨鱼类的α-淀粉酶基因进行了多重比对后设计了2对特异性中间片断引物,以来自胭脂鱼肝胰脏的mRNA为模板扩增得到了胭脂鱼α-淀粉酶的中间片断序列。根据得到的中间片断序列设计了两条用于扩增α-淀粉酶基因的3’端的上游引物,用此两条上游引物和试剂盒提供的两条下游引物,扩增得到了胭脂鱼α-淀粉酶基因的3’端序列。再根据得到的中间片段序列和3’端序列设计了三组5’PACE特异性引物,从而得到了胭脂鱼α-淀粉酶的5’端序列。对所得到的三段序列进行拼接,得到了胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA序列,它全长1633bp,5’非编码区为24bp,编码区包括1539个核苷酸,编码一个长512个氨基酸残基的蛋白质前体,3’非编码区为70bp。2.胭脂鱼α-淀粉酶基因推导氨基酸序列的分析克隆得到的胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA全长(本文此处忽略..)为1633bp,包括一个5’非编码区、一个编码512个氨基酸的开放阅读框、TAA终止密码子和一个包括加尾信号和poly(A)尾的3’非编码区。编码区核苷酸长度为1539bp,编码512个氨基酸,由信号肽(15个氨基酸)、三个活性位点残基,三个氯离子结合位点残基,四个钙离子结合位点残基和10个半胱氨基酸残基构成。3.胭脂鱼α-淀粉酶基因的同源性分析胭脂鱼α-淀粉酶基因的核苷酸序列与许多动物的α-淀粉酶基因具有较强的相似性。在DNAMAN软件上对不同物种的α-淀粉酶基因cDNA全序列进行序列比对,结果表明,胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA序列的编码区与斑马鱼(Daniorerio)、尖吻鲈(Latescalcarifer)、美洲黄盖鲽(Pseudopleuronectesamericanus)、大西洋鲑鱼(Salmosalar)α-淀粉酶的cDNA序列的编码区的一致性为88.50%、78.30%、76.80%、72.51%,全序列的一致性为86.10%、75.26%、75.(文章此处忽略..)17%、70.73%。胭脂鱼α-淀粉酶在氨基酸水平的同源性高于核苷酸水平的同源性。胭脂鱼α-淀粉酶氨基酸与斑马鱼(Daniorerio)、尖吻鲈(Latescalcarifer)、美洲黄盖鲽(Pseudopleuronectesamericanus)、大西洋鲑鱼(Salmosalar)等鱼类α-淀粉酶氨基酸之间的相似性很高,分别为89.65%、82.03%、79.88%、74.80%;而与两栖类的光滑爪蛙(Xenopuslaevis)、哺乳类的猪(Susscrofa)以及人(Homosapiens)的相似性分别为76.39%、74.33%、71.88%。4.胭脂鱼α-淀粉酶基因推导蛋白的分析及其结构预测预测胭脂鱼α-淀粉酶基因编码一个512个氨基酸的多肽链,分子量Mw=56910.87Da,等电点pI=8.49。在氨基酸组成上,甘氨酸含量最高,为11.72%;其次是天冬酰氨、缬氨酸、亮氨酸及丝氨酸,分别为8.98%、7.42%、6.45%、6.05%。二级结构预测表明,其二级结构主要由四种组成,即α-(此处忽略..)螺旋、β-转角、随机卷曲和延伸链,随机卷曲是最主要的二级结构。5.胭脂鱼α-淀粉酶组织表达研究根据胭脂鱼α-淀粉酶cDNA序列,设计了两对基因特异性引物用于胭脂鱼α-淀粉酶组织表达研究,此外,根据金鱼的β-Actin序列设计了一对内参引物。PCR结果显示,在所研究的肝胰脏、前肠、中肠、后肠、肾脏、心脏、脾脏、脑、肌肉和鳃组织中,肝胰脏、前肠、中肠、后肠能检测到明显的α-淀粉酶表达,此外在心脏中也检测到了微弱的α-淀粉酶表达。


以上为本篇毕业论文范文胭脂鱼α-淀粉酶的cDNA克隆与组织表达研究的介绍部分。
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