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13株狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与遗传演变分析

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毕业论文范文题目:13株狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与遗传演变分析,论文范文关键词:13株狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与遗传演变分析
13株狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与遗传演变分析毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:狂犬病是一种重要的人兽共患感染病,由狂犬病病毒(Rabiesvirus,RV或RABV)引起,多少乎感染所有温血动物跟人,发病后逝世亡率近100%。我国年报告狂犬病发病逝世亡人数仅次于印度,位居世界第二,重大威胁公民的生命保险,也给国民大众带来了极为沉重的心理上跟经济上的包袱。RABV宿主动物众多,使得病毒可在不同的宿主间转化,各种带毒动物又可导致RABV在不同地区间迁徙。RABV分子风行病学是利用RT-PCR技巧测定不同毒株的基因组序列,借助各种生物信息学软件进行比较跟分析,从分子程度上研究RABV基因的变异与病毒毒力、抗原性、宿主特异(略..)性等之间的关联,进而断定毒株来源以及彼此间的进化过程,体系控制病毒种系产生及其变异法则,为制订正确的狂犬病防治策略、抉择合适的动物及人用疫苗株提供实际基本。本实验的研究对象为13株RABV街毒株,重要内容如下:1、狂犬病病毒街毒株的分别鉴定乳鼠脑内接种分别法及鼠成神经瘤细胞分别法对13种狂犬病阳性病料进行RABV的分别。利用直接免疫荧光技巧及RT-PCR技巧对接种后的脑组织及细胞进行鉴定。检测成果表明,本实验分别出13株RABV街毒株。2、狂犬病病毒街毒株全基因测序与比较分析设计RABV全基因组分段PCR扩增引物,对PCR产物进行克隆并测序,利用(本文此处忽略..)DNAStar跟Clustalx等生物信息学软件进行序列拼接与编辑,分析全基因组的构造跟组成,并对5个构造基因进行多重序列比对及同源性分析。测序获得13株RABV街毒株的全基因组核苷酸序列,基因组全长11921-11924nts,5个构造基因的ORF,长度分辨为N基因1575nts、P基因894nts、M基因609nts、G基因1575nts、L基因6386nts,N-P-M-G-L间隔区序列长度分辨为2nts、5nts、5nts、422nts,Leader构造跟Trailer构造分辨长50nts跟70nts。本研究发明13株RABV街毒株其全基因组序列在构造及组成上均合乎弹状病毒科狂犬病病毒属的特点,构造基因编码蛋(略..)白质氨基酸序列的同源性均高于核苷酸序列的同源性,GXQZD01、GDMMD57跟HuNPB3这3株病毒间各构造基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性较高,与其余10株病毒间则表示出绝对较低的同源性,而这10株病毒彼此间同源性较高。5个构造基因推导的氨基酸长度未变,在氨基酸序列上均在必定的变异,但构造蛋白的保守区跟重要功能位点均未产生渐变。3、狂犬病病毒街毒株的遗传进化分析利用MEGA等生物信息学软件对本研究中的13株RABV街毒株的构造基因及全基因组绘制遗传进化树,进行种系产生分析。成果显示,13株病毒均属于基因1型,与国外RABV的进化间隔较远,存在较为独特的中国地区(此处忽略..)特点,因此本研究中13株病毒很有可能是存在于天然界中的固有街毒株。N基因进化树与全基因进化树基本上保持一致,基于其余不同基因构建的进化树大体雷同。13株病毒中CDMMD57、GXQZD01跟HuNPB3间亲缘关联较近,与国内鼬獾分别株独特处于较为独破的进化分支上,与泰国等地的人源街毒株进化间隔较近。其余10株病毒间显示出较近的亲缘关联,与国内一些犬源RABV街毒株共处于雷同的进化分支。


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