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利用微卫星标记评估10个中国地方猪品种的遗传多样性

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毕业论文范文题目:利用微卫星标记评估10个中国地方猪品种的遗传多样性,论文范文关键词:利用微卫星标记评估10个中国地方猪品种的遗传多样性
利用微卫星标记评估10个中国地方猪品种的遗传多样性毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:本研究采用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)第X次推荐的51对微卫星标记的荧光引物中的20对引物,借助AB1310自动测序仪,检测我国10个地方猪品种(嵊县花猪SX,南阳黑猪NY,嘉兴黑猪JX,淮南黑猪HU,海南猪HN,赣西两头乌GX,监利猪JL,金华猪JH,东山猪DS,沙子岭猪SZ)在DNA水平上的遗传多样性。结果表明,在20个微卫星座位上,10个猪品种具有的等位基因数目和频率均不同程度地呈现出变异,南阳黑猪具有的平均等位基因数目最多(11.55),金华猪最少(6.25)。其中,一些等位基因如SW1364:158bp等位基因,SW2439:133bp等位基因,SW938:144bp和146bp等位基因,SW2509:176bp和190bp等位基因,SW142:131bp等位基因,PDYN:137bp和139bp等位基因,SW1668:186bp,206bp和208bp等位基因,SW575:147bp和151bp等位基因,S0167:214bp等位基因(略..),为10个猪品种所共有,推测它们可能是我国猪基因组中最为“原始”的等位基因:一些等位基因如SW1678座位上的129bp,131bp,137bp等位基因只在淮南黑猪出现。SW1684座位上的117bp,121bp,127bp等位基因只在南阳黑猪出现。SW2439座位上的113bp,115bp,117bp等位基因只在嘉兴黑猪出现。SW1364座位上的146bp,202bp,220bp等位基因只在赣西两头乌出现。SW938座位上的176bp等位基因只在嵊县花猪上出现。SW1325座位上的108bp等位基因只在沙子岭猪上出现.而126bp等位基因只在海南花猪上出现。SW1632座位上的152bp,158bp,190bp,192bp,194bp,202bp等位基因只在监利猪上出现。SW2509座位上的148bp等位基因只在东山猪上出现。SW142座位上的103bp和107bp等位基因只在金华猪上出现。不同品种,不同位点的特定等位基因见表3。通过20个微卫星座位平均多态信息含量和平均遗传杂合度(本文此处忽略..)2个指标的比较,10个猪品种内遗传变异程度大小依次为海南猪、嵊县花猪、南阳黑猪、监利猪、沙子岭猪、嘉兴黑猪、淮南黑猪、东山猪、赣西两头乌、金华猪。从平均有效等位基因数的比较来看,10个猪品种内遗传变异程度大小依次为海南猪、嵊县花猪、南阳黑猪、沙子岭猪、嘉兴黑猪、淮南黑猪、监利猪、东山猪、赣西两头乌、金华猪。群体间遗传分化系数(GST)和固定指数华中月犯月七,悦月卜祠民吐月仑大(FsT)表明,10个猪品种的遗传变异大部分(约78%)存在于品种内,只有少部分(约22%)存在于品种间。由Nei(1972)氏标准遗传距离,和DA遗传距离(Nei1983),以及在此基础上绘制出NJ聚类图和UPGMA聚类图来看,10个地方猪品种的遗传关系与我国猪种类型划分基本一致,但也略有不同,同属于华中两头乌的4个品种监利猪、东山猪’、赣西两头乌和沙子岭猪以及浙(此处忽略..)江金华猪在NJ聚类图和UPGMA聚类图上,聚成一类,其它5个品种聚成一类,是符合实际情况的,从小的分枝来看,嵘县花猪和南阳黑猪,淮南猪和海南猪的遗传距离最近,分别聚成一类,似乎有点让人难以置信,,因此本研究对其分化时间进行推算,发现以上4个猪品种的分化时间大约在620一630年前,即公元1372一1382年,而中国历史上,这段时期正是明朝洪武年间,内地民族大迁徙的时期,在明政府的高压下,中原地带(即河南、山西、河北等地)向沿海大搬迁,因此推测原属猪品种的南阳黑猪、淮南猪分别和原嗓县、海南猪品种发生了基因交流。但是要提高此推测的可靠性还需其他的旁证相佐,例如可以把以上地方品种的鸡,狗,鸭,猫或牛同样做亲缘关系的分析,观察上述品种是否出现一到两个类似的结果。本研究结果提示,仅依据地理分布、生产性能和外貌特(略..)征等分类,并不能完全反映各个品种间的遗传关系和彼此遗传本质的差异。猪品种的亲缘关系和分化时间在某种程度也反映了人类历史的变迁。


以上为本篇毕业论文范文利用微卫星标记评估10个中国地方猪品种的遗传多样性的介绍部分。
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