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生物序列中功能元件辨认与发明

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毕业论文范文题目：生物序列中功能元件辨认与发明，论文范文关键词：生物序列中功能元件辨认与发明
生物序列中功能元件辨认与发明毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：生物序列中的功能元件是可能把持基因的表白跟调控过程的DNA片段,对它们的研究对人们懂得生物序列的含意存在宏大的意思。本文先对特定功能元件的辨认进行了研究,而后将该问题推广到生物序列中的模式发明问题上,并对生物序列中的模式发明问题进行了一些有利的摸索。生物序列中功能元件的辨认与发明重要有两种方法。一种是有领导的辨认方法（本文此处忽略..）,即利用已知的信息判读一段未知的序列中是否含有某种功能元件;另一种是无领导的学习方法,即利用一些类似性指标,通过搜查算法发明序列中可能蕴含的信号。大肠杆菌启动子能起始基因的转录,它重要由两段比较保守的序列片段-10框、-35框跟它们之间一段长度可变的碱基序列组成。因为保守序列中的碱基是可变的,而且间隔碱基的长度也是可变,这给（文章此处忽略..）大肠杆菌启动子的打算机辨认带来了难度。本文提出了一种基于多特点的大肠杆菌启动子断定算法,即通过词频分析获得序列的组成特点,利用地位权重矩阵(PWM)跟隐马尔科夫模型(HMM)获得序列的构造特点,而后输入到一个分类器中进行分类。文中分辨利用大肠杆菌编码区跟非编码区的序列数据对算法进行了测试,成果表明,该方法的均匀错误率明显低于（本文此处忽略..）其它方法。生物序列中的模式发明是生物信息学中一个极具挑衅性的问题。本文通过研究能恢复出模式的序列片段之间的类似性关联,提出了能恢复出模式的序列片段与该模式之间应当满意的信号相容性前提(Signalcompatiblecondition)。在此基本上,针对单一模式发明问题,文提出并实现了一种穷举搜查的模式发明算法——信号相（略..）容性算法(Signalcompatiblealgorithm,SCA)。通过改进构造搜查图的方法,进而将该算法扩大利用到二元组合模式的发明中。通过仿真数据跟生物数据的测试,该算法能确保发明序列中蕴含的所有模式,同时因为将信号相容性前提作为剪枝准则,该算法存在打算时光短,占用内存少的长处。

以上为本篇毕业论文范文生物序列中功能元件辨认与发明的介绍部分。

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