基于锚定RT-PCR的青蒿EST克隆、测序及生物信息学分析

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基于锚定RT-PCR的青蒿EST克隆、测序及生物信息学分析

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基于锚定RT-PCR的青蒿EST克隆、测序及生物信息学分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：随着人类基因组计划和水稻基因组计划两大里程碑式的生物微观世界探索工程的相继胜利完成，当今分子生物学研究已步入基因组学的新时代。可是，在传统抗疟中药青蒿中，迄今尚未开展大规模基因组测序工作，严重制约了青蒿素基因工程改良的研究进展。为了跟上时代发展的步伐，本研究利用以锚定逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)为（略..）依托的转录物组学技术平台，以盛花期青蒿为材料开展全景式cDNA文库构建工作，结果共获得93个cDNA克隆并完成了序列测定。经过软件分析和序列比对，对54个cDNA序列进行了功能注释，包括青蒿中有测序记录的同种基因1个，其他植物中有测序记录的同源基因33个，无任何测序记录的新基因20个，其中有20个注释序列已在全球共享公共基（此处忽略..）因数据库GenBank上公布，另有34个未注释序列也以表达序列标签(EST)形式打包提交，即将公布。在此基础上，我们依据同源性比较原理，进一步开展了青蒿基因的虚拟定位、克隆归类和分子进化等生物信息学分析。通过这些研究，已在水稻基因组中找到39条与青蒿基因高度同源的祖先序列，并由此绘制出基于比较基因组学的青蒿染色体（此处忽略..）图谱。同时，利用青蒿细胞色素P450还原酶(CPR)基因和18SrRNA基因，通过估算其分子进化距离，构筑了包含多个植物种属的最大简约化系统树，从而拓展了植物分子分类学的研究领域。此外，以本实验室及国内外研究机构所获青蒿基因组学成果为契机，还筹建了一个将向全球开放供免费浏览的青蒿素高级专业网站——青蒿素在线(Arte（本文此处忽略..）Line)。本研究丰富了可利用的青蒿基因资源，必将促进青蒿及其他植物的基因组学研究及基因克隆与鉴定，有助于青蒿基因图谱的构建以至全基因组序列的最终破译，也为今后利用遗传操作技术在体内外重建青蒿素合成途径及开展青蒿素代谢途径工程研究奠定扎实的基础。

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