辽东湾斑海豹MHC-DQB基因的遗传多样性分析

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辽东湾斑海豹MHC-DQB基因的遗传多样性分析

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毕业论文范文题目：辽东湾斑海豹MHC-DQB基因的遗传多样性分析，论文范文关键词：辽东湾斑海豹MHC-DQB基因的遗传多样性分析
辽东湾斑海豹MHC-DQB基因的遗传多样性分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：辽东湾斑海豹(Phocalargha)是惟逐个种能在我国海疆繁殖的鳍足类动物,在《国度重点保护野活泼物名录》中被列为国度Ⅱ级保护动物,其分布区域位于世界上8个繁殖区的最南端,已经与其余繁殖区域的斑海豹产生必定程度的隔离。辽东湾斑海豹数量已不足千头,环境传染、栖身地的破坏跟猎捕等加剧了其天然种群数量的降落,种群状况已气息奄奄。固然对辽东湾斑海豹发展了必定的研究跟保护工作,但重要集中在状况构造、习惯、分布特点以及人工豢养跟繁殖上,大多数保护活动仍然是在缺乏保护遗传学研究的情况下进行的。因此,通过以往的研究不能正确全面的获得其保护遗传学信息。重要组织相容性复合体(major（略..）histocompatibilitycomplex,MHC)是具高度多样性的核基因,在阐明种群间的变异跟适应机制方面更具优胜性。通过MHC基因的变异分析,可有效评估种群遗传多样性程度。本文以辽东湾25份斑海豹样本为研究对象,分析了MHC-DQB第二外显子的基因多态性,探讨跟评估了其种群遗传多样性程度,及在抵抗疾病跟适应环境变更方面的才能跟潜在威胁。从25份斑海豹样本的270多个克隆中,得到141bp的片段。在这些序列中发明21个变异位点,定义了12个等位基因。氨基酸变异率为25.5%。等位基因之间的遗传间隔范畴是0.0071～0.1064,均匀值为0.0577,不等同位基因之间的碱基差别是1～15bp,均匀差别数为8bp,表示出较丰富（此处忽略..）的遗传多样性。在56条序列中发明13种可疑序列,猜忌长短特异性扩增造成的微卫星序列。对核苷酸调换的类型及位点进行分析,发明非同义调换率明显高于同义调换率(均匀dN/ds=2.07),由此造成的氨基酸调换集中在肽结合位点PBR附近,表明斑海豹的DQB基因受到强烈的正抉择或均衡抉择作用。大部分调换的氨基酸跟被调换的氨基酸理化性质不同,这种理化性质的改变,可能与它们辨认跟提呈不同的抗原有关。构建的体系发育树及TCS网络图显示,鳍足类MHC基因表示出跨物种进化景象,ds值分析也支撑这一论断。斑海豹DQB等位基因分布不均衡,罕见等位基因不成比例,暗示辽东湾斑海豹可能经历过遗传瓶颈效应。11个（本文此处忽略..）样本呈现多于两条等位基因的情况,揣测存在基因反复景象。DQB第二外显子包含两个富含GC的区域(即GCi跟GCii),含类似X的序列,显示出一种纯粹的重组信号。根据体系发育树、中接网络图、TCS网络图跟种群遗传构造分析对斑海豹的位点进行探讨,认为斑海豹的59个等位基因可能来自DQB的两个位点跟DRB的一个位点。通过打算各个位点的单倍型多样性、核苷酸多样性跟均匀核苷酸歧义度等遗传多样性参数,并与其余鳍足类的遗传间隔、每个个体所含等位基因数、碱基及氨基酸变异等参数进行比较,发明各个位点的遗传多样性程度较高。通过Tajima'D测验跟Fu'Fs测验,以及对非同义调换率与同义调（此处忽略..）换率进行比较,成果显示,DQB受到正抉择的作用。这在必定程度上支撑了达尔文的天然抉择学说。基因反复跟每个位点的基因多样性独特作用,使斑海豹MHC表示出丰富的多态性,可能最大限度的适应多变的病原体环境。然而,等位基因分布不均衡,假如罕见等位基因在遗传漂变的作用下在斑海豹种群中消散,将会导致斑海豹多样性的进一步丧失,从而丧失对多样化病原体的抵抗才能。因此,在保护斑海豹生存环境的同时,还必须尽可能多地保护物种的遗传多样性,才干真正达到保护物种的目标。

以上为本篇毕业论文范文辽东湾斑海豹MHC-DQB基因的遗传多样性分析的介绍部分。

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