大鲵胸腺素β-4基因跟α1-血红蛋白基因的生物信息学分析与表白研

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大鲵胸腺素β-4基因跟α1-血红蛋白基因的生物信息学分析与表白研

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毕业论文范文题目：大鲵胸腺素β-4基因跟α1-血红蛋白基因的生物信息学分析与表白研，论文范文关键词：大鲵胸腺素β-4基因跟α1-血红蛋白基因的生物信息学分析与表白研
大鲵胸腺素β-4基因跟α1-血红蛋白基因的生物信息学分析与表白研毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：大鲵(Andriasdavidianus)俗称“娃娃鱼”,属两栖纲(Amphibia)有尾目(Caudata)隐鳃鲵科(Cryptobranchidae)大鲵属(Andrias)，它是一种水生到陆生之间的适度物种,在进化上非常原始,也是我国特有的珍稀野活泼物,重要分布在长江中上游、汉水上游及珠江中上游的深山峡谷的溪流中，其对生存水质请求较高，喜明澈水质，并且爱好低温。因为近些年来大鲵生存环境日益恶化,如环境传染、人为捕杀等,造成大鲵天然资源的重大衰竭。因为大鲵属于我国的濒危爱护保护动物，所以目前对大鲵的研究重要集中在保护遗传学方面,这些研究对大鲵的种质资源管理跟人工增殖提供了重要的意思，而绝对对于大鲵皮肤活性物质的相干研究则较（此处忽略..）少。本研究对从大鲵皮肤cDNA文库中分别获得大鲵α1-血红蛋白基因跟大鲵胸腺素β-4基因进行生物信息学分析其全长cDNA序列。其中利用在NationalCenterforBiotechnologyInformation（NCBI）中进行BLASTN跟BLASTX序列的类似性分析及基因解释，用ScanSitepI/Mw分析蛋白质性质，singalP4.0查找信号肽，Protscale分析疏水构造，TMHMM猜测跨膜构造，再用SMART软件进行蛋白质特点模体检测，跨膜螺旋猜测利用Tmpred软件，SPOMA猜测二级构造，Phyre进行验证，Swiss-model做三级构造猜测。利用qRT-PCR方法对大鲵α1-血红蛋白基（此处忽略..）因跟胸腺素β-4基因在肠、肌肉、皮肤、胃、肾、肺、肝脏等组织中的表白进行荧光定量检测。获得了如下成果：（1）、生物信息学分析表明，本研究获得的大鲵α-血红蛋白基因全长cDNA序列为594bp，开放浏览框共432bp，编码144个氨基酸，编码的大鲵α1-血红蛋白揣测的实际分子量为16048.3u，等电点为6.44。氨基酸组成中酸性氨基酸11.9%，中性氨基酸69.9%，碱性氨基酸18.2%。构造分析表明该蛋白不信号肽，但在100-122个氨基酸处以及98-122个氨基酸处罚别有由里向外、由外向里的跨膜螺旋区，二级构造以α-螺旋为主。氨基酸序进行同源性列比对表明与人、猕猴的亲缘关联最近，同源性达到63.0%，其次是跟小鼠、猪、爪蟾，同源性为59.0%左右，而跟牛蛙的亲缘关联最低只有46.7%。荧光定量PCR成果表明，α1-（文章此处忽略..）血红蛋白基因在肌肉中表白量最高，在胃中最低。（2）、大鲵胸腺素β-4基因全长共699bp,其中开放浏览框204bp，5’-UTR87bp，3’-UTR为474bp；该基因编码68个氨基酸，其中包含43个成熟肽，实际分子量为7649.7u，等电点为5.81。大鲵胸腺素β-4构造分析表明该蛋白的第7到43位有“THY”特点模体，不跨膜螺旋区、细胞外跨膜构造域；氨基酸序列进化关联表明，大鲵与人、小鼠等哺乳动物同源性最高，其次是猪、鸡，与爪蟾、倭蛙属的同源性为80.0%，与斑马鱼最低为62.2%；荧光定量PCR成果表明，胸腺素β-4基因在肺中表白量最高。除此之外，本实验在构建大鲵胸腺素β-4原核表白载体时，采取全人工合成，将大鲵Tβ4基因中Arg、Gly、Leu等7个氨基酸罕见密码子改革为大肠杆菌偏（略..）爱的密码子，并将合成的大鲵胸腺素β-4成熟肽跟pET32a载体上的硫氧化还原蛋白、HisTag融合表白，蛋白质电泳检测表明，重组菌在IPTG引诱4小时后在濒临26kDa处获得融合表白蛋白，该蛋白在除去融合表白的硫氧化还原蛋白、HisTag后，分子量为5kDa，跟预期的目标蛋白大小一致。表明大鲵Tβ4原核表白载体构建成功，将为进一步研究该基因对大鲵各项生理调节机制奠定基本。

以上为本篇毕业论文范文大鲵胸腺素β-4基因跟α1-血红蛋白基因的生物信息学分析与表白研的介绍部分。

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