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高丹草EST-SSR引物设计及遗传图谱的构建

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毕业论文范文题目:高丹草EST-SSR引物设计及遗传图谱的构建,论文范文关键词:高丹草EST-SSR引物设计及遗传图谱的构建
高丹草EST-SSR引物设计及遗传图谱的构建毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:高丹草是高梁和苏丹草的杂交种(Sorghumbicolor×S.Sudanense),是以利用茎叶为主的一年生禾本科牧草。高丹草结合了双亲的优点,表现出了显著的种间杂种优势,在畜牧、水产养殖业及资源利用与环境保护上有着广阔的应用前景。本研究以高粱EST的数据为基础,设计了103对EST-SSR引物,并分析了影响引物多态性的因素;以TX623A×S722(皖草2号)的F2群体为作图群体,选取已公布的高(略..)粱SSR引物和自行设计的EST-SSR引物,构建了高丹草分子遗传图谱,并同Bhattramakki等和Wu等构建的高粱遗传图谱进行了比较。得出如下结论:1.103对EST-SSR引物在高粱品种TX623A和苏丹草品种S722进行了PCR扩增和多态性检测,结果表明,80对引物同时在两品种中扩出了条带,其中达到预期产物大小的引物69对;20对引物表现出多态性;9对引物只在高粱TX623A中扩出了条带;14对引物未在两(略..)品种中扩出产物。BLAST结果表明,103对EST-SSR引物中的90对引物都能唯一定位到高粱染色体的特定位置上,表现出很好的特异性。2.多态性分析结果表明,来自二重复基元序列的EST-SSR引物多态性最高(22.4%),其次是来自三重复基元的引物(13.5%),来自四重复基元的引物中没有发现多态性引物;来自SSR长度大于20bp的EST序列的引物有很高的多态性(23.4%),明显高于SSR长度介于14bp和20bp之间的EST(本文此处忽略..)序列设计的引物(12.8%)。3.构建了一个包含5个连锁群,51个标记的遗传图谱,覆盖基因组长度527.0cM,平均图距10.3cM。其中,LGA包含了22个标记;LGB包含14个标记;LGC包含5个标记;LGD和LGE分别包含7个和3个标记。遗传距离最长的连锁群是LGA为227.4cM,最小的是连锁群LGE为4.1cM。平均图距最大的是连锁群LGB为14.8cM,最小的是连锁群LGE为1.4cM。4.同Bhattramakki等和Wu等构(本文此处忽略..)建的高粱遗传图谱比较,结果表明本文图谱上有9个引物与Bhattramakki等构建的高粱图谱有很好的一致性;有4个引物与Wu等构建的高粱图谱有很好的一致性。


以上为本篇毕业论文范文高丹草EST-SSR引物设计及遗传图谱的构建的介绍部分。
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