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哺乳动物基因组插入、缺失的模式研究

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毕业论文范文题目:哺乳动物基因组插入、缺失的模式研究,论文范文关键词:哺乳动物基因组插入、缺失的模式研究
哺乳动物基因组插入、缺失的模式研究毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:多种哺乳动物基因组数据,尤其是人类基因组数据的完成,标志着当代生物学进入了后基因组时代。在基因组的以千兆为计量单位的序列中,蕴藏着丰富且未知的信息。将其中大量的信息提取并加以分析,成为后基因组时代挑战当代生物学家的一大难关。基因组研究的一个主要目的是研究物种或个体基因组间的差异,这些差异又是由遗传变异造成的。一种改变遗传变异的机制是突变。突变有很多种形式,(本文此处忽略..)遗传密码中一个位点的碱基变成另一个碱基的突变称为点突变;一个基因中一段DNA的插入或缺失分别是一个插入或缺失;另外,基因或部分基因可能倒位。插入、缺失及替换是进化过程中三种主要的突变形式。研究表明,替换发生的频率是插入、缺失的数倍,然而在基因组进化中插入、缺失起主要作用。因此,研究插入、缺失的模式对于研究哺乳动物基因组的进化机制非常有必要。序列比对是研究基(本文此处忽略..)因组间差异及物种进化等方面的强有力的工具。进行序列比对的核心是得分系统,包括得分矩阵和罚分方式,主要由插入、缺失及替换的分布推导演变而来。本研究的主要目的是通过研究插入、缺失的模式来获取插入、缺失与替换一体的,具有坚定进化基础的对位的得分系统,从而为获得正确的序列对位坚实的理论基础。本文从UCSC数据库下载28个脊椎动物基因组的多重序列比对结果,并编程挑选其中(本文此处忽略..)的15个哺乳动物基因组,统计插入、缺失的数目,计算其发生频率,进而分析其分布特征。主要获得如下结果:(1)单个核苷酸的插入、缺失发生频率最高,分别占总插入的28.63%到41.78%,总缺失的26.54%到45.93%;(2)研究14个物种的长度不超过10bp的插入缺失表明,除了Opossum,插入较缺失发生频繁,缺失插入总个数比为0.85:1;其他物种的缺失都比插入发生更频繁,缺失插入总个数比从1.21变到1.87。本研究所用插入、缺失(略..)数据是先前此类研究的很多倍,所得结果却基本一致。因此,高频率的单个核苷酸的插入、缺失及缺失比插入发生频率似乎是基因组进化中的一种普遍现象;(3)插入、缺失的发生频率随着其长度的增加而减少;(4)与幂函数相比,伽玛分布的拟合效果更好,更能精确地描述插入、缺失的长度分布。


以上为本篇毕业论文范文哺乳动物基因组插入、缺失的模式研究的介绍部分。
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