以9311为背景的日本晴染色体片段置换系的构建及相关QTL分析

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以9311为背景的日本晴染色体片段置换系的构建及相关QTL分析

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毕业论文范文题目：以9311为背景的日本晴染色体片段置换系的构建及相关QTL分析，论文范文关键词：以9311为背景的日本晴染色体片段置换系的构建及相关QTL分析
以9311为背景的日本晴染色体片段置换系的构建及相关QTL分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：农作物株高、品质等许多农艺性状多属于复杂的数量性状。近年来,随着生物技术的发展,利用分子标记技术,对控制这些性状的QTL数目、在染色体上的位置及遗传效应等进行了研究和分析,并取得了一定进展。遗憾的是,当前的研究报道多以F2、BC1、DH和RIL群体为研究对象,由于这些群体的遗传背景较为复杂,很难从根本上提高QTL定位的精确性,也难于对相关QTL进行准确的效应估算。染色体片段置换系是指一套以同一亲本为遗传背景,置换了供体亲本一个或少数染色体片段的株系所组成的群体。由于其群体遗传背景较单一,可大大提高对复杂数量性状基因定位的精确性,并通过构建次级分离群体可实现目标QTL的精细定位。本研究以两个测序的水稻品种为材料,利用高代回交和分子标记辅助选择相结合的方法,构建了一套以"9311”为遗传背景,覆盖供体亲本“日本晴”全基因组的水稻染色体片段置换系群体,并用于水稻数量性状相关基因的全面剖析,以期发现并进一步精细定位和图位克隆新的相关QTL座位,为利用分子标记辅助选育优良性状的水稻品系及水稻功能基因组的研究奠定基础。主要研究（本文此处忽略..）结果如下：1)从来自于公共数据库开发的153对SSR引物中,筛选出均匀分布于水稻12条染色体上的104对SSR多态性引物,多态比率为68.2%。利用相对均匀分布于水稻12条染色体上的这104对引物构建了分子标记连锁图谱,该图谱覆盖水稻全基因组1494.0cM,标记间平均间距为14.37cM。用于分析BC4F1单株的基因型及利用分子标记辅助选择目标单株。2)利用104对多态性SSR引物检测BC4F1单株的基因型,选择基因组内杂合片段较少的单株种子,种植得到BC4F2群体,再利用目标标记对BC4F2群体进行基因型检测,最终获得122个CSSL。这些CSSL的置换片段平均估算长度为23.4cM,绝大部分分布1-15cM、16-30cM和31-45cM范围内,分别有43个、46个和21个；置换片段大于45cM的有12个。122个CSSL分布于水稻12条染色体上,从第4和11染色体上的6个到第6染色体16个不等,平均每条染色体有10.2个置换片段。置换系的置换片段总长度为2854.4cM,相当于水稻基因组大小的1.9倍,置换片段对水稻基因组的覆盖总长度为1301.8cM,平均覆盖率为86.7%。3)以94个CSSL群体为试验材料,分析CSSL群体及双亲的米粒长(milledricelength,MRL)、饭粒长(cook（略..）edricelength,CRL)和米粒延伸性(cookedriceelongation,CRE)。利用代换作图法,共定位了12个与米粒延伸性相关的QTLs.这些QTLs分布于水稻第3、4、6、8和第9染色体,其中2个MRLQTLs位于第3染色体,1个MRLQTL位于第8染色体；4个CRLQTLs位于第3、6、8和第9染色体；5个CREQTLs位于第4、6、9、10和第11染色体。延伸性QTL的加性效应变化范围为-5.80～-0.14,加性效应百分率为-12.26%～-1.72%,其中qCRE-6加性效应较大。米粒延伸性相关QTL的鉴定和初步定位为其进一步的精细定位及利用分子标记辅助选择(marker-assistedselection,MAS)改良稻米品质奠定了基础。4)以94个CSSL群体为试验材料,调查和分析CSSL群体及双亲的穗颈长度。结果表明：在17个置换系中检测到8个控制水稻穗颈长度的QTL,分别位于第2、3、7、8、9和第11染色体；利用代换作图法,定位了其中的8个穗颈长度QTL；其加性效应值介于0.10～3.20之间,其中qPE-9和qPE-11的加性效应值较大,平均效应值分别为3．15和2.95,表现为主效基因特征；qPE-2-2、qP（略..）E-3-1、qPE-3-2、qPE-7和qPE-8等5个QTL被定位在小于10.0cM的区段内。利用CSSL可以有效地鉴定水稻穗颈长度QTL,这些QTL为分子标记辅助选育穗颈长度适中的水稻品系及其进一步的精细定位奠定了基础。5)以94个CSSL群体为试验材料,以P≤0.01为阀值,对置换片段上的抽穗期QTL进行了鉴定。采用代换作图法共定位了4个控制水稻抽穗期的QTL,分别位于第3、4、5和笫8染色体；QTL的加性效应值为-6.4--2.7,加性效应百分率为-6．4%～-2.7%；qHD-3和qHD-8加性效应值较大,表现主效基因特征。为了进一步定位qHD-3和qHD-8,在目标区域加密16对SSR引物,qHD-3和qHD-8分别被界定在第3染色体RM3166和RM16206、第8染色体RM4085和RM8271之间,其遗传距离分别为13.9cM和6.4cM。该结果为分子标记辅助选择改良水稻生育期奠定了基础。6)利用以9311和日本晴构建的94个染色体片段置换系为材料,采用代换作图法对控制水稻谷粒酚反应的3个QTL进行了定位。结果表明,4个染色体片段置换系材料酚反应级别为4,其余的在0到1级之间。其中8个置换系均含有来源于日本晴的1个置换片段。3个控制水稻苯酚反（文章此处忽略..）应的基因qPH4-1、qPH2和qPH7被界定在第2染色体RM406和RM240、第4染色体RM280和RM5709及第7染色体RM11和RM6574之间,遗传距离分别为12.9cM、9.5cM和16.0cM。qPH4-1、qPH2和qPH7的鉴定和初步定位为其进一步的精细定位和图位克隆奠定了基础。本研究结果证实利用构建的CSSL群体进行相关QTL分析是可行和有效的。

以上为本篇毕业论文范文以9311为背景的日本晴染色体片段置换系的构建及相关QTL分析的介绍部分。

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