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水稻土细菌跟氨氧化细菌的RFLP分析

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毕业论文范文题目：水稻土细菌跟氨氧化细菌的RFLP分析，论文范文关键词：水稻土细菌跟氨氧化细菌的RFLP分析
水稻土细菌跟氨氧化细菌的RFLP分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：细菌在生态体系的能量转化跟食品链中既是初级出产者又是分解者,细菌的多样性在农业生态体系中又存在各种不同的功能。氮是动物成长所必须的养分元素,是泥土出产力的重要限度性因素。硝化作用中第一步反应NH_4~+一NO_2~-由氨氧化细菌(AOB)实现,是硝化过程的限速步骤。水稻是人类赖以生存的粮食作物,水稻根际是一个特别的生态环境,水稻根际微生物对水稻的出产、泥土构造与肥力保持,以及在养分元素的流动过程中起侧重要的作用。通过对水稻根际土细菌跟氨氧化细菌多样性的研究,阐明根际泥土环境与细菌及氨氧化细菌群落构造之间的彼此关联,可能加深人们对动物-泥土-微生物彼此关联的懂得跟意识,对进步作物产量、保护环境等方面存在重要的意思。本实验以陕西省武功县大田苗期水稻鲜土为研究对象,通过直接法提取根际水稻土跟非根际水稻土微生物（本文此处忽略..）总DNA。采取细菌16SrDNA通用引物对(63F/1387R)跟氨氧化细菌16SrDNA特异性引物(Eub338跟Nso1225)分辨对细菌及氨氧化细菌16SrDNA进行PCR扩增,将扩增片段与pMD19-T载体连接后转入大肠杆菌JM109中,通过蓝白斑筛选挑取阳性克隆子,分辨树破水稻根际土跟非根际土细菌、水稻根际土跟非根际土氨氧化细菌等4个16SrDNA克隆文库。通过菌落PCR方法,从4个文库中分辨随机挑取约150个阳性克隆,以pMD19-T载体通用引物M13从新扩增插入的16SrDNA片段,进行克隆文库的菌落PCR,将纯化后的菌落PCR产物分辨用HhaI跟RsaI两种限度性内切酶水解,进行RFLP分型分析。利用α多样性的测度分析RFLP的成果,聚类分析以细菌分布之间的Bray-Curtis相异性测度系数为间隔指标,用非加权均匀配对法(UPGA)在NTsys2.10统计软件长进行数（文章此处忽略..）据处理。选取水稻根际土氨氧化细菌的上风克隆进行测序,所得的部分16SrDNA序列在NCBI上BLASTN比较,断定上风氨氧化细菌的种属;综合测序所得序列及NCBI上的相干序列,通过ClusterX及MEGA4.0构建进化树。获得的重要实验成果如下:(1)从水稻根际土中获得124个细菌的酶切类型,库容值为21.28%;从水稻非根际土中获得116个细菌的酶切类型,库容值为27.86%;从水稻根际土中获得110个氨氧化细菌的酶切类型,库容值为51.70%;从水稻非根际土中获得105个氨氧化细菌的酶切类型,库容值为52.26%。(2)采取α多样性的测度对所得的细菌的RFLP分型数据进行分析,Shannon-Wiener(H′)多样性指数:水稻根际土为4.764,水稻非根际土为4.658;Margalef丰富度指数(d_(Ma)):水稻根际土为24.855,水稻非根际土为23.272;Pielou均匀度指数(J_(gi)):水稻根际土为0.988,水（此处忽略..）稻非根际土为0.980。其成果由大至小均为根际水稻土大于非根际水稻土。成果表明,水稻根际土中微生物物种丰富度较高,品种分布较均匀,构成功能体系较完美的微生物群落。(3)采取α多样性的测度对所得的氨氧化细菌的RFLP分型数据进行分析,Gini(D_g)多样性指数:水稻根际土为0.984,水稻非根际土为0.986;均匀度指数(J_(gi)):水稻根际土为0.952,水稻非根际土为0.966;物种丰富度指数(d_(Ma)):水稻根际土为21.297,水稻非根际土为20.621;最大物种多样性指数(H_(max)):水稻根际土为4.701,水稻非根际土为4.654。(4)根际水稻土上风氨氧化细菌G5、G13、G14、G26、G33、G42跟G111的16SrDNA序列比对表明:G14跟G111与亚硝化螺菌属(Nitrosospirasp.)同源性分辨达到97%跟93%;G33跟G13与未培养亚硝化单胞菌属(UnculturedNitrosomonadaceaebacterium)同源性（本文此处忽略..）分辨达到98%跟92%;G26跟G42与未培养β-变形菌亚门(UnculturedBeta-proteobacterium)同源性分辨达到99%跟99%。G5与未培养碱菌属(UnculturedAlcaligenaceaebacterium)同源性达到97%。

以上为本篇毕业论文范文水稻土细菌跟氨氧化细菌的RFLP分析的介绍部分。

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