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砂梨分子遗传图谱的构建及其果皮色泽性状的定位分析

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毕业论文范文题目:砂梨分子遗传图谱的构建及其果皮色泽性状的定位分析,论文范文关键词:砂梨分子遗传图谱的构建及其果皮色泽性状的定位分析
砂梨分子遗传图谱的构建及其果皮色泽性状的定位分析毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:梨分子遗传图谱的构建和农艺性状的基因定位对于挖掘梨基因资源,促进梨分子辅助育种有重要意义。本文首先利用NCBI的GenBank数据库和GDR数据库中梨EST序列筛选SSR序列用于开发砂梨SSR引物;并用这些引物对砂梨‘西子绿×喜水’F1群体遗传多样性进行分析;再应用“双假测交理论”(Doublepseudo-testcross),利用砂梨杂交F1代群体(西子绿×喜水)构建砂梨基于SSR、EST-SSR和RAPD等3种分子标记的遗传连锁图谱;最后利用BSA法筛选控制砂梨褐皮性状的(此处忽略..)分子标记,并对其进行了基因定位分析。主要的结果如下:1、利用NCBI的GenBank数据库和GDR数据库中梨EST序列,筛选到60个SSR序列,分布于54条EST中,其中二核苷酸重复基元出现频率最高达51.7%,三核苷酸重复基元占25%,六核苷酸重复基元最低,仅为1.7%。23种重复基序中AT重复基序出现频率最高。根据54条含SSR序列的EST设计25对EST-SSR引物,其中14对引物在‘西子绿×喜水’F1杂交群体中获得有效扩增,9对引物呈现多态性,多态性引物占设计引物的36%。这些引物在F1群体中扩增产物的等位基因数(文章此处忽略..)(No)平均为2,有效等位基因数(Ne)平均为1.9324,平均杂合度观察值(Ho)和期望杂合度(He)分别为1和0.4809。2、以‘西子绿×喜水’的F1代群体为试材,对SSR、EST-SSR和RAPD标记在F1代群体中分离方式及分离比例进行了分析。结果表明:在P=0.01水平上,SSR标记呈孟德尔分离和偏孟德尔分离的频率分别为91.8%和8.2%;EST-SSR标记呈孟德尔分离、偏孟德尔分离和异常分离的频率分别为66.7%、22.2%和11.1%;RAPD标记呈孟德尔分离与偏孟德尔分离的频率分别为94.5%和5.5%。采用JoinMap3.0软件,对120对SSR引物、9对(此处忽略..)EST-SSR引物和45条RAPD引物扩增所得的有效标记位点进行连锁分析,构建了‘西子绿×喜水’的分子遗传图谱,含有162个分子标记,其中SSR标记53个、EST-SSR标记2个、RAPD标记107个,分属19个连锁群(LG1-LG19),连锁群LOD值在2.0-8.0之间,总长度覆盖梨基因组901cM,标记间平均距离为5.63cM,图谱覆盖率为56.8%。3、采用SSR标记筛选与砂梨果皮色泽性状相连锁的分子标记,从120对多态性SSR引物中筛选出CH05g02和NH015b在DNA池间存在差异;经后代群体验证和遗传连锁分析证实,CH05g02位点与砂梨果(文章此处忽略..)实褐色性状相连锁;经克隆测序,该SSR标记长度为114bp,命名为CH05g02114。该标记与控制砂梨果实褐色性状位点的遗传距离是4.6cM,并定位于分子遗传图谱的LG5连锁群上。


以上为本篇毕业论文范文砂梨分子遗传图谱的构建及其果皮色泽性状的定位分析的介绍部分。
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