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水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位

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毕业论文范文题目:水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位,论文范文关键词:水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位
水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:粳型水稻Y98149是从离子束诱变后代中获得的显性半矮秆突变体。本研究利用RAPD方法在水稻显性半矮秆突变体Y98149和其野生型Y98148之间进行了RAPD标记筛选工作,从基因组水平上揭示了两者的差异程度,为突变的基因提供分子生物学证据。对稳定的多态性RAPD标记进行了SCAR标记转化,成功地获得了与3个与水稻显性半矮秆基因连锁的SCAR标记,并对克隆的RAPD标记进行了相关序列分析,结果表明:1、利用1100个10碱基寡核苷酸随机引物筛选Y98148和Y98149,共获得4个稳定的多态性引物:S1041、S1075、S1076和S1272;2、通过计算得到(此处忽略..)突变体Y98149与其野生型Y98148的相似系数为0.9995,遗传距离为0.0005,表明Y98148与Y98149遗传背景具有极高的相似性,为证明二者是近等基因系提供了分子水平证据;3、通过克隆、测序,成功地得到3个RAPD标记的序列,分别命名为S1041_(525)、S1076_(549)和S1272_(403),提交到DDBJ数据库,接受号为AB207912、AB207913和AB207914;根据所测的序列设计特异性引物,并在近等基因系间进行了PCR分析,成功地将RAPD标记S1041_(525)、S1076_(549)、S1272_(403)转化为SCAR标记SCS1041_(498)、SCS1076_(510)、SCS1272_(388);4、利用Y98148×Y98149的F_2分离群体384个单株对SCAR标记进行了验证和连锁分(此处忽略..)析,SCAR标记SCS1041_(498)、SCS1076_(510)和SCS1272_(388)PCR扩增结果与田间农艺性状吻合率分别为88.8%、93.2%和85.2%,与显性半矮秆基因的遗传距离分别为12.6cM、7.5cM和16.3cM;5、通过序列分析和同源性搜索,片段S1041_(525)和S1076_(549)分别编码111和90个氨基酸序列的多肽,其中S1076_(549)的多肽序列与原核生物的蔗糖磷酸转移酶基因有94%的同源性,与一些植物中的膜蛋白也有相当高的同源性。片段S1272_(403)的核苷酸序列与水稻第七染色体上的两个BAC克隆B1249D05(AP006451)和OJ1212_C12(AP005604)同源性为99%,B1249D05和OJ1212_C12是重叠克隆,S1272_(403)位于二者重叠区域中,进而初(此处忽略..)步将水稻显性半矮秆基因定位于第七染色体上。本研究通过分子生物学方法鉴定了新的水稻显性半矮秆基因,获得了研究该基因的有利的分子标记,为该基因的利用提供了有用的信息。水稻显性半矮秆基因初步定位的完成,为下一步精细定位和图位克隆该基因奠定了坚实的基础。


以上为本篇毕业论文范文水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位的介绍部分。
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