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罗非鱼不同群体遗传变异的微卫星标记分析

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毕业论文范文题目:罗非鱼不同群体遗传变异的微卫星标记分析,论文范文关键词:罗非鱼不同群体遗传变异的微卫星标记分析
罗非鱼不同群体遗传变异的微卫星标记分析毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:本研究采集了来自淡水渔业研究核心的尼罗罗非鱼埃及品系、88品系跟奥利亚罗非鱼,与来自广西水产所的尼罗罗非鱼、美国品系跟奥利亚罗非鱼共174个样品的血样,采取酚/氯仿法提取基因组DNA,利用微卫星标记技巧,分析了6个群体在25个微卫星基因座的遗传多样性,探讨了各群体内的遗传变异跟各群体间的遗传关联,打算了等位基因频率、群体杂合度(功、有效等位基因数、多态信息含量、群体间的Nei's标准遗传间隔(Ds)跟DA遗传间隔等,并利用Ds遗传间隔分辨构建了6个罗非鱼群体的体系聚类图。研究成果如下:1.利用所选的25个微卫星基因座对6个罗非鱼群体的174个个体进行PCR扩增,得到特异性的扩增产物。共检测到143个等位基因,均匀每个基因座5.72个等位基因,最多为8个,起码为3个;有效等位基因数量总共为66.91,有效等位基因(文章此处忽略..)数小于实际察看等位基因数,这是等位基因分布不均匀的成果。同时进行上风等位基因分析,成果表明:25个微卫星基因座都有上风等位基因存在。2.Hardy-Weinberg均衡测验成果表明:用基于马可夫链模型的Hardy-Weinberg正确P值的无偏估测对各群体的多基因座检测发明,6个罗非鱼群体都处于遗传均衡状况;而对各基因座进行的多群体检测发明,有4个基因座呈现了明显的遗传不均衡性;单群体单基因座检测发明,6个群体中有8.11%的基因座处于遗传不均衡状况。究其起因有随机交配产生偏移、遗传漂变及抉择等因素,其中抉择所造成的影响最大,其次为随机交配产生的偏移以及遗传漂变。3.根据统计成果可知:25个微卫星基因座大部分为高度多态性基因座,均匀多态信息含量在0.404-0.6735之间,6个罗非鱼群体存在的(略..)遗传多样性适中,各个群体的均匀PIC值在0.4212~0.6105,尼罗罗非鱼美国品系的PIC最高为0.6105,PIC最低的为核心奥利亚罗非鱼群体。6个群体察看杂合度变更范畴在0.7253~0.8160之间,冀望杂合度变更范畴在0.5146~0.6834之间,杂合度较高,其中杂合度最高的是广西尼罗群体,核心奥利亚群体则为最低。4.用PopGene1.32软件软件分辨打算了6个罗非鱼群体之间的Nei's标准遗传间隔跟DA遗传间隔,并用MEGA3软件对其进行聚类,成果表明:由Nei's标准遗传间隔用附近结合法(NJ法)聚类所得的成果与各群体之间的历史来源、选育方法、人工抉择强度等特点基本吻合。用Ds遗传间隔将6个群体分为两类:Ⅰ类:尼罗罗非鱼埃及品系、尼罗广西群体、尼罗罗非鱼美国品系跟尼罗罗非鱼88品系聚为一类。在这四个群体中尼罗罗非鱼埃及品系(此处忽略..)首先与尼罗广西群体聚到一起,而后又跟尼罗罗非鱼美国品系相聚,最后尼罗罗非鱼88品系与它们聚在一起。Ⅱ类:核心奥利亚罗非鱼群体跟广西奥利亚罗非鱼群体聚为一类。5.F-统计量分析表明:微卫星基因座的杂合性基因多样性的比率(FST)的变更范畴是从基因座UNH738的0.0779到基因座UNH183的0.3484,均匀值为0.1937;基因流(Nm)在0.4675(基因座UNH183)跟1.8425(基因座UNH189)之间变动,均匀值为1.0407。6.尼罗罗非鱼埃及品系跟尼罗广西群体间的标准遗传间隔跟分化指数分辨为0.1913、0.0904,两个奥利亚群体之间的标准遗传间隔跟分化指数分辨为0.0911、0.0599。通过分子方差分析,奥利亚罗非鱼变异来源群体间所占的比例为6.82%,而尼罗罗非鱼变异来源群体间所占的比例为13.08%。表明淡水渔业研究核心选育的“夏奥1号”奥利亚罗非鱼合适其余处所养殖,尼罗罗非鱼的选育还(本文此处忽略..)须要考虑各个养殖区域的情况进一步提纯。本文的聚类成果与群体的历史来源、选育方法、人工抉择强度等特点基本吻合。阐明了Ds跟DA这两种估算遗传间隔的方法结合微卫星标记构建体系产生树是可行的。本研究的成果可为正确评估各群体遗传多样性的资源价值、制订公道可行的保种跟选育打算提供实际根据。


以上为本篇毕业论文范文罗非鱼不同群体遗传变异的微卫星标记分析的介绍部分。
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