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人类肠道病毒A组山东处所株的基因型分布及其所致疾病分子风行病

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毕业论文范文题目:人类肠道病毒A组山东处所株的基因型分布及其所致疾病分子风行病,论文范文关键词:人类肠道病毒A组山东处所株的基因型分布及其所致疾病分子风行病
人类肠道病毒A组山东处所株的基因型分布及其所致疾病分子风行病毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:[背景]人类肠道病毒(HumanEnterovirus,HEV)属于渺小核糖核酸病毒科(Picornavirdae)肠道病毒(Enterovirus)属,是一类在人类肠道繁殖的常见病毒。HEV通常以无症状的隐性感染为主,病人跟无症状带毒者为其重要的感染源,重要通过分泌物或排泄物及其传染的物品而经粪-口、日常接触、空气飞沫等道路传播,对易感人群存在高度的感染性,儿童是最敏感的人群,受感染后可获得免疫力。HEV在人体肠道中增殖,但很少引起腹泻等消化道症状,是以消化道为原发灶的全身感染,感染过程中构成病毒血症,在临床上可引起多种疾病,如急性跟缓性麻痹(AcuteFlaccidParalysis,AFP)、脑膜炎或脑炎、心肌炎、急性出血性结膜炎、手足口病(Hand,FootandMouthDisease,HFMD)、类感冒病症等。近年来,由HEV引起的各种疾病的产生率始终呈明显回升趋势。传统上根据病毒在人或灵长类动物来源细胞上的复制才能,在不同动物品种上的感染性、致病性跟抗原差别性,将HEV按血清型分为脊髓灰质类(以下简称脊灰)病毒(Poliovirus,PV1-3型)、柯萨奇病毒(Coxsackievirus)A型(CVA1-22跟24型)、柯萨奇病毒B型(CVB1-6型)、埃可病毒(Echovirus,ECHO1-7、9、11-27、29-33型)。跟着分子生物学技巧与生物信息学技巧的利用,根据生物学及遗传特点,HEV被从新划分为A、B、C、D共4个基因组,其中HEV-A包含17个基因型,即CVA2-8、10、12、(此处忽略..)14、16、肠道病毒71型(EV71)、EV76、EV89-92。HEV病毒的基因组为单股正链RNA,长约7.5kb,起mRNA作用,全部基因组只含有一个开放浏览框架(OpenReadingFrame,ORF),编码多聚蛋白(Polyprotein),最后产生4个构造蛋白(VP1-VP4)跟7个非构造蛋白。构造蛋白中的VP1蛋白是最重要的衣壳蛋白,是HEV与宿主细胞上受体进行辨认、结合的重要构造,很多重要的血清型特异性中跟位点位于其上;它岂但与病毒的抗原性有关,而且位于病毒颗粒名义,处于机体免疫压力下易产生变异而构成不同的风行株。因此,对VP1蛋白核苷酸序列的研究,既可能断定HEV的基因型别,又可能阐明病毒核酸之间的类似程度,提示它们之间同源性的大小,从而明白病毒来源及其传播链。HEV-A可能引起AFP、无菌性脑膜炎、HFMD、疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)等多种疾病,其中以HFMD最为常见。而引起HFMD最常见的病原体为EV71跟CVA16。山东省是HFMD的高发省份之一,自2007年至今每年都会产生HFMD的风行。本研究通过对近些年分别到的HEV-A山东处所株的基因型进行分析,特别是对HFMD病例标本中分别毒株的VP1蛋白的编码基因进行分析,从分子风行病学角度摸索HEV-A与HFMD的关联,为制订HFMD及其HEV感染所致疾病的防治策略提供科学根据。[研究目标]1.懂得HEV-A山东处所株的基因型分布,树破HEV-A山东处所株的VP1区基因核苷酸序列数据库;2.分析HEV-A山东处所(本文此处忽略..)株重要型别的遗传进化特点;3.探讨HEV-A重要型别与其所致疾病之间的接洽,分析遗传变异对其致病性跟风行法则的影响,为相干疾病的防备把持提供实际根据。[研究方法]1.对源于1998-2009年AFP监测体系中的病例标本跟2007-2010年部分HFMD病例标本,采取细胞培养的方法进行病毒分别,阳性分别物利用HEV组合血清进行中跟实验,断定其血清型。2.对病毒分别阳性但中跟实验无奈定型的毒株,提取核酸并进行VP1基因扩增跟序列测定。3.将测得的基因序列进行剪裁、拼接,得到VP1区基因核苷酸序列。利用NCBI提供的BLAST服务器进行序列比对,断定HEV-A山东处所株的基因型别。4.将HEV-A山东处所株与GenBank中检索到的其它国度跟地辨别别株,采取BioEditSequenceAlignmentEditorsoftware5.0.9软件,对其VP1区核苷酸序列及其推导的氨基酸序列进行同源性比较。5.采取Mega3.1软件,以相邻连接方法(Neighbor-joiningMethod)构建VP1区体系产生树,对HEV-A山东处所株进行亲缘进化分析。[重要成果]1.山东省目前分别到10个基因型的HEV-A,分辨为CVA4、CVA5、CVA6.CVA10、CVA12、CVA14、CVA16、EV71、EV76跟EV90。2.CVA4山东处所株与其原型株VP1区部分基因核苷酸跟氨基酸同源性分辨为83.8%~85.3%跟97%-99.6%,绝对CVA4原型株,重要表示为核苷酸的变异,氨基酸序列存在4个重要变异位点;VP1区部分基因体系产生树显示,CVA4可能划分为A(此处忽略..)-E5个基因簇(Cluster),山东处所株分辨位于ClusterC跟E。3.CVA6山东处所株与其原型株VP1区部分基因核苷酸跟氨基酸同源性分辨为81.3%~81.5%跟94.4%-95.0%;VP1区部分基因体系产生树显示,CVA6可能划分为A-C3个Cluster,山东处所株位于ClusterC,并来自同一传播链(Lineage)。4.CVA10山东处所株与其原型株VP1区部分基因核苷酸跟氨基酸同源性分辨为75.6%-76.8%跟90.2%~93.2%;VP1区部分基因体系产生树显示,CVA10可能划分为A-G共7个Cluster,山东处所株分辨位于ClusterF跟G。5.CVA16山东处所株与其原型株VP1区核苷酸跟氨基酸同源性分辨为75.5%-77.1%跟91.5%-92.2%;VP1区全基因体系产生树显示,CVA16可能划分为A、B2个基因型,山东处所株存在B1a跟B1b2个传播链(Lineage)的共轮回。6.EV71山东处所株与其原型株VP1区核苷酸跟氨基酸同源性分辨为82.0%-82.9%跟94.2%~95.2%,与C4亚型核苷酸同源性最高,为91.8%-93.7%;VP1区全基因体系产生树显示,EV71可能划分为A、B、C3个基因型;山东处所株均属于其中的C4亚型,所有C4亚型毒株在第249位氨基酸上表示为与C1-C3亚型不同的氨基酸变异(Ⅰ→Ⅴ)。7.2007年临沂市HFMD暴发重要病原为EV71,且位于C4亚型的C4a进化分支;2008~2010年山东省HFMD风行的重要病原体为EV71跟CVA16,兼有CVA4、CVA6、CVA10等其它HEV-A的参加。【重要论断】1.EV71跟CVA16是山东省HEV-A的上风型别,其它基因型HEV-A也有分布,并在HFMD等疾病的暴发与风行中占(文章此处忽略..)领必定的比例。2.HEV-A山东处所株的遗传进化存在必定的方向性跟牢固性。比拟CVA16,EV71有较快的进化速率,目前分别到的EV71山东处所株均属于同一进化来源(C4a),CVA16山东处所株存在2个传播链的共轮回。3.部分基因型HEV-A山东处所株的遗传进化存在着必定的地区分布特点。HEV-A各基因型在长期独特进化的过程中可能产生型内或型间重组。4.EV71是中国大陆近些年产生HFMD的暴发跟风行的重要病原,其构造蛋白VP1区遗传进化较牢固,未发明基因重组。自1998年以来C4a是中国大陆独一风行的EV71的基因亚型,揣测其非构造蛋白编码区产生重组是造成其持续风行的起因之一


以上为本篇毕业论文范文人类肠道病毒A组山东处所株的基因型分布及其所致疾病分子风行病的介绍部分。
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