禽新城疫病毒新疆分离株F和HN基因序列测定与遗传进化分析

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禽新城疫病毒新疆分离株F和HN基因序列测定与遗传进化分析

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毕业论文范文题目：禽新城疫病毒新疆分离株F和HN基因序列测定与遗传进化分析，论文范文关键词：禽新城疫病毒新疆分离株F和HN基因序列测定与遗传进化分析
禽新城疫病毒新疆分离株F和HN基因序列测定与遗传进化分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：本试验分离获得了6个NDV新疆分离株,对分离病毒的鉴定结果表明,所分离的6株病毒均具有血凝特性,其血凝性均可被NDV的阳性血清所抑制而不被禽流感(H9和H5)单因子阳性血清及EDS-76阳性血清抑制。通过RT-PCR方法扩增NDV/Chicken/XJ/3/07株、NDV/Chicken/XJ/7/07株和NDV/Chicken/XJ/9/08株等5个NDV新疆分离株的F全长基因。序列分析表明,5个NDV新疆分离株F基因的核苷酸序列分别为1662bp、1589bp、1676bp、1586bp和1662bp,均含有一个开放阅读框,分別编码553、528、553、520和553个氨基酸。根据基因裂解位点的氨基酸序列分析表明,NDV/Chicken/XJ/10/08株属于强毒株,NDV/Ch（本文此处忽略..）icken/XJ/3/07株、NDV/Chicken/XJ/7/07株、NDV/Chicken/XJ/9/08株和NDV/Pigeo-n/XJ/11/08株属于弱毒株。遗传发育进化树分析表明,4个弱毒株与LaSota、Clone30、B1、BEA-45在同一亚群,属基因Ⅱ型,1个强毒株与TaiWan95、广东株(GD-1-98)、江苏株(JS-5-1)在同一进化分支内,属基因Ⅶ型。通过RT-PCR方法扩增了NDV/Chicken/XJ/9/08株、NDV/Chicken/XJ/10/08株和NDV/Chicken/XJ/17/08株3个NDV新疆分离株的HN全长基因。序列分析表明,3株NDV的核苷酸全长序列分别为1734bp、1716bp和1716bp,分別编码577、571和571个氨基酸。核苷酸（文章此处忽略..）序列比对分析结果显示,NDV/Chicken/XJ/9/08株与LaSota疫苗株相比,在12、188、377、459、1067和1390等多个位点发生了突变;NDV/Chicken/XJ/10/08株和NDV/Chicken/XJ/17/08株与Taiwan95强毒株同源性很高,在227-560和1120-1141区域有数个连续碱基不同,差异相对较少。根据HN基因编码多肽长度分析表明,NDV/Chicken/XJ/9/08株为弱毒株,NDV/Chicken/XJ/10/08株和NDV/Chicken/XJ/17/08株为强毒株。基因进化树分析表明,NDV/Chicken/XJ/9/08株与LaSota株、Clone30、B1株(NDVⅡ系)等疫苗株的亲缘关系很近并位于同一分支,而其它两株与江苏株(J（略..）S/4/05)、浙江株(ZJ/1/00)、Taiwan95等强毒株位于同一进化分支内,但与疫苗株的亲缘关系较远。NDV/Chicken/XJ/9/08株、NDV/Chicken/XJ/10/08株和NDV/Chicken/XJ/17/08株HN基因的毒力分析结果与这些毒株F基因的分析结果完全一致。NDV/Chicken/XJ/3/07株、NDV/Chicken/XJ/7/07株、NDV/Chicken/XJ/9/08株和NDV/Pigeon/XJ/11/08株虽然为弱毒株,且与LaSota株、Clone30、B1株(NDVⅡ系)等弱毒疫苗株的亲缘关系很近,但其核苷酸序列许多位点发生了突变;NDV/Chicken/XJ/10/08株和NDV/Chicken/X（文章此处忽略..）J/17/08株属于强毒株,并且为ND较流行的毒株。因此,在ND的预防中,要加强免疫监测,制定合理的免疫程序。

以上为本篇毕业论文范文禽新城疫病毒新疆分离株F和HN基因序列测定与遗传进化分析的介绍部分。

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