禽感染性支气管炎病毒Sczy3株全基因组序列测定分析

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禽感染性支气管炎病毒Sczy3株全基因组序列测定分析

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毕业论文范文题目：禽感染性支气管炎病毒Sczy3株全基因组序列测定分析，论文范文关键词：禽感染性支气管炎病毒Sczy3株全基因组序列测定分析
禽感染性支气管炎病毒Sczy3株全基因组序列测定分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：鸡感染性支气管炎(IB)是由鸡感染性支气管炎病毒(IBV)引起的一种鸡的急性、高度接触性感染病。当初已经在寰球风行蔓延,给世界家禽养殖业带来极大的经济丧失。因为禽感染性支气管炎病毒(IBV)频繁的基因点渐变跟重组,目前已经呈现了很多不同的血清型跟基因型毒株,并且它们之间缺乏穿插保护性或穿插保护性低,所以分析某地区风行的IBV的基因组构造特点,有助于IB的防控。先前研究证明,近年来四川IBV分别株基因型重要是LX4即QX-like型。从S1基因进化树（文章此处忽略..）分析推出Sczy3分别株属于QX型,然而Sczy3基因组的其余基因片段还未被测序。本研究利用RT-PCR方法对Sczy3分别株基因组全序列进行测定,成果表明Sczy3分别株存在典范的禽状病毒基因序列特点5'Cap-1a-1b-S-3a-3b-(E)-M-5a-5b-N-3'PolyA。Sczy3分别株基因组长27695bp,含有10个开放浏览框(ORF)。Gene1(复制转录酶)含有两个开放浏览框ORF1a跟ORF1b,分辨由11856跟7959个核苷酸组成,编码3951个跟2652个氨基酸；Gene2(纤突蛋白基因,S)含有一（本文此处忽略..）个开放浏览框由3498个核苷酸组成,编码1165个氨基酸,其中S1基因编码540个氨基酸。Gene3(帮助蛋白基因)包含三个开放浏览框ORF3a、ORF3b跟ORF3c(E),分辨编码57、62跟108个氨基酸；Gene4(膜蛋白基因,M)一个开放浏览框,由678个核苷酸组成,编码225个氨基酸；Gene5(帮助蛋白基因)含三个开放浏览框ORF5a跟ORF5b,分辨编码65跟82个氨基酸；Gene6(核衣壳蛋白基因,N)由1230个核苷酸组成,编码409个氨基酸。部分相邻基因间有重叠景象。Gene1跟Gene2重叠110nt,Gene2跟Gene3重叠32n（略..）t,Gene3跟Gene4重叠114nt,Gene5跟Gene6重叠159nt。核酸序列同源性比较表明Sczy3与参考毒株基因组序列同源性在86.1%-94.1%之间,与QX-likeIBV有核苷酸同源性最高,与Mass型IBV核苷酸同源性最低。S蛋白裂解位点分析表明H-R-R-R-R不是中国分别毒株特有的裂解位点。体系进化树分析显示,与LX4型IBV亲缘关联较近,与Mass型Conn型IBV毒株亲缘关联很远。重组分析揣测,Sczy3是一株嵌合IBV毒株,假订婚本毒株是LX（此处忽略..）4跟H120。综上所述,本实验课题为深刻研究IBV在中国的演变特点,以及IBV的反向遗传学提供参考根据,同时也丰富了冠状病毒IBV的生物信息数据库。

以上为本篇毕业论文范文禽感染性支气管炎病毒Sczy3株全基因组序列测定分析的介绍部分。

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