不同GC含量的背景序列集在顺式调控模块猜测模型中的比较研究

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不同GC含量的背景序列集在顺式调控模块猜测模型中的比较研究

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毕业论文范文题目：不同GC含量的背景序列集在顺式调控模块猜测模型中的比较研究，论文范文关键词：不同GC含量的背景序列集在顺式调控模块猜测模型中的比较研究
不同GC含量的背景序列集在顺式调控模块猜测模型中的比较研究毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：研究背景在人类基因组上正确辨认转录调控信号仍然是分子生物学界面临的重要挑衅，目前打算的手段仍然是寻找转录调控元件的重要方法。然而这些方法广泛存在假阳性率过高的问题，而降落假阳性率的方法之一就是参数的优化抉择。这些猜测算法都广泛须要一个背景序列集作为练习凑集中的阴性凑集，咱们假设背景序列凑集的抉择对猜测算法的猜测才能会产生重要影响，然而目前很少有人研究背景序列的抉择问题。研究目标(1)测验背景序列的抉择是否会对转录调控元件的猜测产生重大影响。(2)在目前常用的多少种背景序列集中，找出最合适的背景序列集。(3)找到背景序列凑集影响猜测模型的起因。对象跟方法本文采取地位权重矩阵(PWM)表示每个转录因子的结合模式，采取逻辑斯克模型(LRA)来模仿转录因子与DNA模板的结合。本文采取受试（略..）者工作特点曲线(ROC)来衡量各个模型的猜测才能，并采取曲线下面积(AUC)来比较各个模型的猜测才能。成果在肝脏组织中：(1)以随机从人类基因组上随机选取序列为背景序列凑集的猜测模型对应的曲线下面积小于以启动子区序列为背景序列凑集的猜测模型对应的曲线下面积。(2)在咱们抉择的肝脏特异的转录因子中，大部分转录因子与DNA模板的结合模式是AT-rich。(3)在利用地位权重矩阵打算的得分比较中，HGP凑集得分高于启动子区序列凑集得分，并且成果存在明显的统计学意思。在骨骼肌组织中：(4)在以HGP为背景序列集跟以启动子区序列为背景序列集对应的曲线下面积之间不明显的统计学差别。(5)在抉择的骨骼肌特异的转录因子中，与DNA模板的结合模式属于AT-rich跟GC-rich的转录因子的个数一样多。(6)在通过（此处忽略..）地位权重矩阵打算的得分比较中，HGP凑集得分与启动子区序列得分之间不明显的统计学差别。论断(1)背景序列集的抉择确切会对转录调控元件的猜测产生重大影响。(2)在目前风行的多少种背景序列集中，最合适的背景序列集是根据转录因子的结合位点的序列模式的GC含量来抉择的背景序列集。(3)假如一个组织的转录因子多结合于GC-rich的DNA序列模体，则采取随机从基因组抉择的序列做背景序列集，可能进步转录调控元件猜测模型的敏感度跟特异度；而假如一个组织的转录因子多结合AT-rich的DNA序列模体，则采取启动子区的序列做背景序列集，也能进步转录调控元件猜测模型的敏感度跟特异度。研究目标：探讨衡量青岛港职工多重心血管危险因素凑集的3种人体测量指标(腰围、体重指数跟腰臀比)的差别。研究方法：利用（文章此处忽略..）2000年青岛港健康研究横断面考察的18～54岁11359名(男性8758，女性2601)职工完全材料进行分析，包含血压，身高，体品质，腰围，臀围，血糖，胆固醇，三酰甘油，总胆固醇，高密度脂蛋白胆固醇程度。利用Logistic回归模型打算3种人体测量指标与心血管危险因素的关联，采取ROC曲线分析打算三种人体测量指标的不同程度辨认多重心血管危险因素凑集的敏感性跟特异性，比较不同测量指标对应的曲线下面积，并断定腰围的最佳截断点。研究成果：①男性重要危险因素程度(身高、体品质、体重指数、腰围、臀围、腰臀比)均高于女性(P＜0.05)。②肥胖、高血压、糖尿病跟代谢综合征等心血管危险因素的患病率均高于女性，差别有明显性(P＜0.05)。③跟着体重指数、腰围跟腰臀比的增加，男性患2型糖尿病、高血压、血脂异样跟多重危险因素凑集的危险都是增加（略..）的。然而绝对体重指数跟腰臀比，跟着腰围的增加，心血管事件产生的危险的增加是更快的。在女性中有与男性类似的景象。④采取腰围猜测高血压、糖尿病、血脂异样跟危险因素凑集的曲线下面积都高于体重指数跟腰臀比，差别有明显性(P＜0.05)。猜测糖尿病、高血压、血脂异样跟危险因素凑集的最佳腰围截断点，女性分辨为76cm，76cm，72cm，79cm；男性分辨为85cm，85cm，83cm，85cm。研究论断：腰围较体重指数跟腰臀比能更好的猜测心血管危险因素。男性腰围最佳切点为85cm，女性为79cm。

以上为本篇毕业论文范文不同GC含量的背景序列集在顺式调控模块猜测模型中的比较研究的介绍部分。

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