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冠环属线虫rDNA-ITS序列分析及系统发育研究

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毕业论文范文题目:冠环属线虫rDNA-ITS序列分析及系统发育研究,论文范文关键词:冠环属线虫rDNA-ITS序列分析及系统发育研究
冠环属线虫rDNA-ITS序列分析及系统发育研究毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:寄生线虫的种类繁多,具有消化道,以宿主的消化物、肠组织、体液或血液为生,易导致宿主出现贫血等临床症状,使宿主的健康受到损害;有些种类分泌的物质对宿主的各个器官功能造成危害;其生活史复杂,病程长,会削弱人或动物的免疫力,影响宿主的生长发育甚至生殖机能;有时一种家畜体内可寄生几种线虫,给治疗带来困难。因此,针对不同寄生线虫种类的调查研究十分重要,为各类线虫病的诊断鉴别及预防控制奠定理论基础,确保畜牧业和人类的生产生活健康发展。在国外,关于寄生线虫的分类、生活史、流行病学研究、现代分子分类鉴定及系统(本文此处忽略..)发育学等方面的研究已多有报道。国内对于各类寄生线虫的形态学分类和分子分类鉴定分析也有不少,但对于圆线虫的分子分类鉴定方面仍很欠缺。本论文首次对河南省驴体内寄生3种冠环属圆线虫的分子鉴定分析和系统发育进行详细地研究。本实验以我国河南省驴体内寄生的3种冠环属线虫(冠状冠环线虫、大唇片冠环线虫、小唇片冠环线虫)的5个样品为研究对象,运用保守引物NC5和NC2扩增单条虫体rDNA的内转录间隔区(ITS)及5.8S序列,将扩增产物回收纯化、测序及序列分析。测序结果显示,ITS及5.8S序列总长为748-843bp,变异位点(包含缺失)共(本文此处忽略..)有119个,简约信息位点18个;其中ITS-1全长为367-370bp,变异位点14个,简约信息位点9个;ITS-2长度为228-320bp(其中冠状冠环线虫有92bp的长片段缺失),变异位点105个,简约信息位点9个;5.8S全长均为153bp,且序列完全一致。序列组成分析表明,ITS-1序列的G+C含量(48.00-48.50%)明显高于ITS-2序列(37.70-40.30%);冠环属5条序列ITS序列多态性位点共出现5处,2处分别在ITS-1比对总长的106位和168位,3处分别在ITS-2比对总长的172位、220位和310位。经过序列两两比对分析得知,3种冠环属圆线虫ITS-1的种间差异性为1.89-2.71%,ITS-2的种间差异性为5.66-31.88%。同时,(此处忽略..)将测得的5条序列提交到Genbank,并获得了序列登录号(JN786948-JN786951)。将本研究获得的序列与Genbank相应种的序列两两比对分析,得到3种冠环线虫ITS序列的差异性范围为0-0.83%。ITS序列的种间变异程度大于种内变异程度,且差异显著,说明ITS序列可以作为鉴定冠环属线虫的可靠的分子遗传标记。以微小杯冠线虫为外群,用本研究获得的5条序列与从Genbank获得的3条序列为数据基础,用邻接法和最大简约法构建系统发育树。结果显示,在存在多个单倍体型和样品来自不同地理区域的情况下,大唇片冠环线虫、小唇片冠环线虫和(文章此处忽略..)冠状冠环线虫均各自聚成一支;而且大唇片冠环线虫和小唇片冠环线虫总聚在一个较大分支内,说明两者的亲缘关系较近,从表6也可以看出,它们的遗传距离较小,表明它们之间的亲缘关系较近;而冠状冠环线虫则另聚成一支,表明与前两者的亲缘关系较远。


以上为本篇毕业论文范文冠环属线虫rDNA-ITS序列分析及系统发育研究的介绍部分。
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