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蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建及分子对接

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毕业论文范文题目: 蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建及分子对接,论文范文关键词: 蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建及分子对接
蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建及分子对接毕业论文范文介绍开始:
   蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建及分子对接,硕士学位论文,共81页。
  摘 要
  烟碱乙酰胆碱受体 (nicotinic acetylcholine receptor, nAChR)是介导传递突触间快速信息的配体门控离子通道蛋白,主要存在于脊椎动物和昆虫的中枢神经系统中,同时它也是新烟碱类杀虫剂的作用靶点。近年来,新烟碱类杀虫剂的发展较快,已占杀虫剂市场的 50%左右,但新烟碱类杀虫剂对蜜蜂的安全问题越来越受到重视。为了探究吡虫啉分子对蜜蜂和桃蚜 nAChR 作用模式的异同点,找出其作用于 nAChR 的关键部位,本研究以计算机辅助药物设计技术为基础,分别构建了蜜蜂(α1)2(β1)3型和桃蚜(α2)2(β1)3型 nAChR。经过拉氏图、分
  子动力学模拟和 RMSF 图等实验方法对构建模型的合理性进行了验证。将吡虫啉与蜜蜂(α1)2(β1)3型 nAChR 和桃蚜(α2)2(β1)3型 nAChR 进行分子对接,  讨论了吡虫啉分子与两者对接结果的相似性和差异性。对接打分Cscore 值与结合自由能较为吻合,说明了对接打分的合理性。结果显示,尽管吡虫啉对两者均有较强的毒性,但作用机制却不尽相同。其硝基部分在对接中起到了关键作用,是吡虫啉对两模建受体无明显选择性作用的主要原因,同时也从理论上阐明了吡虫啉的使用危害到了蜜蜂群体的生存。随后将另外六个新烟碱类也进行了对接,
  结果表明六种化合物与桃蚜 nAChR 的结合较为稳定,打分较高;对蜜蜂 nAChR而言,烯啶虫胺、噻虫胺、噻虫啉的作用效果较为明显,而啶虫脒、噻虫啉、呋虫胺对蜜蜂 nAChR 的作用效果较弱。这一结论与新烟碱类的实际使用情况和相关测试结果基本一致。 
  关键词:蜜蜂(α1)2(β1)3型 nAChR, 桃蚜(α2)2(β1)3型 nAChR, 新烟碱类杀虫剂,吡虫啉, 同源模建, 分子对接
  
  目 录
  摘 要 I
  Abstract III
  引 言 1
  第 1 章 烟碱乙酰胆碱受体与新烟碱类杀虫剂 3
  11 烟碱乙酰胆碱受体 3
  111 简介 3
  112 烟碱乙酰胆碱受体和乙酰胆碱蛋白研究 5
  12 新烟碱类杀虫剂 6
  121 简介 6
  122 新烟碱类的市场占有情况 7
  123 适用范围和对象 8
  124 吡虫啉的问世 10
  125 吡虫啉使用带来的危害 11
  13 近年来国内开发的新型新烟碱类化合物 12
  第 2 章 生物信息学与药物研发现状 17
  21 数据资源相关介绍 17
  211 小分子数据库 17
  212 生物学数据库 18
  22 新药研发 20
  23 药物仿制 21  
  第 3 章 计算机辅助药物设计介绍 23
  31 计算机辅助药物设计的出现 23
  32 CADD 主要软件的介绍 24
  321 SYBYL 的简要介绍 24
  322 其它主要药物设计软件介绍 27
  33 通过计算机辅助药物设计开发出的的新药实例 28
  34 计算机辅助药物设计的实验方法 29
  341 间接药物设计 29
  342 直接药物设计 30
  第 4 章 蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建 33
  41 引言 33
  42 模建步骤 34
  43 序列比对与构建模型的结果与讨论 36
  第 5 章 新烟碱类化合物以及环氧啉的分子对接 47
  51 引言 47
  52 对接方法 47
  53 对接结果与讨论 49
  531 吡虫啉分子的对接结果 49
  532 其它新烟碱类化合物的对接结果 55
  54 环氧啉与蜜蜂、桃蚜受体的分子对接 57
  第 6 章 结 论 61
  参考文献 63
  公开发表论文 71
  致谢 73
 


以上为本篇毕业论文范文 蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建及分子对接的介绍部分。

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