松江鲈(Trachidermus fasciatus)种群的状况学与遗传学研究及四种

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松江鲈(Trachidermus fasciatus)种群的状况学与遗传学研究及四种

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松江鲈(Trachidermus fasciatus)种群的状况学与遗传学研究及四种毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：松江鲈(TrachidermusfasciatusHeckel)附属于鲉形目(Scorpaeniformes)、杜父鱼科(Cottidae)、松江鲈属(Trachidermus),为小型降河洄游鱼类,是我国水生野生二级保护动物、中国优先保护鱼类一级物种名录,于2004年被列入中国物种红色名录。本文利用状况学跟线粒体DNA序列及ISSR(Inter-simplesequencerepeat)的方法分辨对采自丹东、秦皇岛跟文登松江鲈3个群体进行了研究。应用主成分分析、聚类分析跟单因子方差分析方法对3个群体的20个量度特点跟7个分节特点进行了研究。成果显示不同群体在可数性状上除尾鳍鳍条数有差别外,其余可数性状无明显差别;3个群体在5个量度特点上存在明显差别,不同群体间存在必定的差别。但这些差别属于种内不同地理群体间的差别。利用PCR技（此处忽略..）巧扩增了丹东、秦皇岛跟文登3个群体线粒体DNA把持区片段,在获得的512bp的D-loop序列中发明37个多态核苷酸变异位点,86个个体存在48种单倍型,丹东群体的DNA序列多态最丰富(1.228%),遗传多样性较高,秦皇岛群体的最低(0.538%)。群体间跟群体内遗传间隔相称;分子变异分析显示,松江鲈群体间存在明显的遗传分化。利用Kimura-2模型构建的NJ树显示:各群体不构成明显分支。中性测验跟核苷酸不配对分布揭示松江鲈经历了近期的群体扩大事件。成功扩增了松江鲈细胞色素b序列片段,在402bp的Cytb基因片段中,13个个体呈现了5种单倍型,3个群体有1个共享单倍型。共发明5个变异位点,核苷酸多样性(π)为0.3%,单倍型多样性(h)为0.628。与把持区序列比拟,Cytb基因比较保守。对松江鲈的线粒体16SrRNA基因片段进行了扩增跟序列测定,得到长度为572bp的序列片段,碱（文章此处忽略..）基含量的均匀值为(%):A=28.8,T=23.9,C=23.8,G=23.5,11条序列片段共发明3个变异位点,4种单倍型h=0.4909,π=0.12%。其进化速率最慢,最为保守。利用6个ISSR引物在3个群体85个个体中扩增出的条带数量22～97不等,片段大小在0.2～2.5kb之间,其中多态片段为324条。丹东野生群体的Shannon多样性指数最高(H=0.3507),秦皇岛人工繁育群体最低(H=0.2769),即松江鲈野生群体的遗传多样性程度高于人工繁育群体。秦皇岛人工繁育群体与丹东跟文登两野生群体间遗传分化系数(Gst=0.34900;Gst=0.39646)明显高于丹东野生群体跟文登野生群体间的遗传分化系数(Gst=0.07240),而丹东跟文登两野生群体间的基因流(6.40608)明显高于这两个群体与秦皇岛人工繁育群体的基因流(0.93266;0.76116)。本文第二部分选取了四种鳕科鱼类:狭鳕(Theragrachalcogramma)、太平洋鳕(Gadusmacroce（略..）phalus)、蓝鳕(Micromesistiuspoutassou)跟远东宽突鳕(Eleginusgracilis),对其线粒体16SrRNA、CytochromeoxidasesubtmitI(COI)跟细胞色素b(cytb)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差别。通过PCR扩增跟序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分辨为539bp(16SrRNA)、601bp(COI)跟385bp(cytb),其中共检测到189处核苷酸调换,蛋白质编码基因上的核苷酸调换重要是第三密码子位点上的同义转换。基因片段的A+T含量都较高。核苷酸组成分析成果表明,Cytb与COI两个蛋白质编码基因的鸟嘌呤含量广泛较低,这一点在其第三密码子位点上表示最为明显。4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸调换速率顺次为CytbCOI16SrRNA（本文此处忽略..）。Cytb基因片段序列的分析成果显示太平洋鳕跟狭鳕间不合时光约为219万年,产生于中新世(Miocene);宽突鳕与蓝鳕间不合时光约为653万年,产生在上新世(Pliocene)。根据遗传间隔构建的NJ体系树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关联较近,与蓝鳕的亲缘关联较远。

以上为本篇毕业论文范文松江鲈(Trachidermus fasciatus)种群的状况学与遗传学研究及四种的介绍部分。

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