6株猪圆环病毒流行毒株全基因组的序列测序及分析

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6株猪圆环病毒流行毒株全基因组的序列测序及分析

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毕业论文范文题目：6株猪圆环病毒流行毒株全基因组的序列测序及分析，论文范文关键词：6株猪圆环病毒流行毒株全基因组的序列测序及分析
6株猪圆环病毒流行毒株全基因组的序列测序及分析毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：Porcinecircovirustype2(PCV2)不仅是引起仔猪断奶多系统衰竭征的主要病原体，而且还与其它病症相关。PCV2的危害在于能够使感染猪只的免疫功能受到损害，这种可导致机体免疫抑制的病毒，由于经常以亚临床感染的形式出现，常易被忽视。因此应当进一步加强对PCV2感染的流行病学及分子病学研究。本研究（略..）采用PCR诊断技术对所收集的73份疑似PCV2病的病料进行检测，得到18份PCV2阳性病料。采用反向PCR技术对阳性病料中的6株猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)进行全基因的扩增、克隆和测序，得到长度为1768或1767bp的目的基因片段。应用DNAstar序列分析软件对所测定的6株PCV2序列进行同源性分析。结果显示，六株之间的核苷酸同源性为95.（此处忽略..）5％～100％。应用计算机分析两个主要阅读框ORF1和ORF2并推导其氨基酸序列，分离株ORF1的核苷酸及氨基酸之间的同源性分别为96.9％～100.0％和98.1％～100％，说明ORF1非常保守，这与其编码蛋白的功能有关。分离株ORF2之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为92.9％～100％和92.3％～100％，变异相对于ORF1较大，与国外已发表毒株的ORF2比较，（文章此处忽略..）发现变异主要发生在三个区域，其中两个与病毒的抗原表位相对应，推测这些变异可能与PCV2抗原性及致病性的改变有关。应用Mega和CLUSTAL分析软件对分离株和国内外已发表的34株PCV2及2株PCV1序列进行比较，并建立了遗传进化树。该进化树主要分为两大群，两个基因型遗传距离上相对较远，分为两群。PCV2各分离株（文章此处忽略..）之间存在着某种地理区域上的相关性，分为两大群，以美国和加拿大为代表的一群，以及以法国为代表的一群。本实验分离株皆属第二群，说明广西株与法国株亲缘关系较近。

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