鸡感染性支气管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因组序列分析及弱毒

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鸡感染性支气管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因组序列分析及弱毒

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毕业论文范文题目：鸡感染性支气管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因组序列分析及弱毒，论文范文关键词：鸡感染性支气管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因组序列分析及弱毒
鸡感染性支气管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因组序列分析及弱毒毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：本课题组2009年从内蒙发病肉鸡群分别得到一株病毒,通过对分别株进行病毒状况察看、鸡胚致病性实验、血凝特点实验等生物特点鉴定及RT-PCR方法检测,鉴定为鸡感染性支气管炎病毒。本研究利用RT-PCR方法对ck/CH/LNM/091017分别株基因组全序列进行测定,并与27株参考毒株基因组序列进行分析跟比较,同时构建体系进化树,以阐明ck/CH/LNM/091017分别毒株与参考毒株之间的体系进化关联跟分子遗传变异关联,并通过动物保护实验对本研究中的分别株进行免疫效力评估。从发病鸡群采集病变组织样品,经处理后接种9~11日龄SPF鸡胚,收集72小时内鸡胚尿囊液(弃去24h逝世胚)。传代后鸡胚呈现侏儒胚、胚体弥漫性出血、羊膜增厚等病变特点。病毒尿囊液与1%鸡外周血红细胞不产生凝集反应,电镜下病毒粒子呈典范的冠状病毒特点,初步鉴定（略..）为鸡感染性支气管炎病毒。本研究通过RT-PCR方法对ck/CH/LNM/091017分别株鉴定及测定全基因组序列,并与27株参考毒株基因组序列进行比较分析,成果表明ck/CH/LNM/091017分别株存在典范的禽冠状病毒基因序列特点5’-replicase-S-3a-3b-M-5a-5b-N-3’。ck/CH/LNM/091017分别株基因组全长27646bp,A+T含量为61.88%,它与27株参考毒株全基因同源性在85.7%~99.9%之间。经基因组全序列体系进化树跟基因组内各基因体系进化树分析,本实验所分别的IBV毒株(ck/CH/LNM/091017)与Mass型参考毒株分布在同一基因群内,属于Mass型IBV。ck/CH/LNM/091017分别株非构造蛋白ORF1a跟ORF1b由11802跟7959个核苷酸组成,分辨编码3933个跟2652个氨基酸组成的多肽。IBV遗传变异型的呈现是因为少数S蛋白氨基酸的改变（略..）,其中S1基因的多样性导致的点渐变、插入、缺失或重组,是IBV产生新血清型、亚型或变异株的重要起因。ck/CH/LNM/091017S基因开放浏览框由3489个核苷酸组成,编码1162个氨基酸,裂解位点为Arg-Arg-Phe-Arg-Arg,其中S1基来由1611个核苷酸组成,编码537个氨基酸残基组成的多肽。M蛋白跟E蛋白分辨编码225个跟109个氨基酸。N蛋白由1230个核苷酸组成,编码409个氨基酸。ck/CH/LNM/091017分别株各基因核苷酸序列与Mass型疫苗株H120的核苷酸序列同源性均在99.0%以上,亲缘关联非常近,所以ck/CH/LNM/091017毒株可能是由疫苗株产生点渐变产生的新毒株或是分别到的疫苗毒。因为IB活疫苗存在毒力返祖景象,并且疫苗株有必定的致病性跟传播才能,所以弱毒疫苗有可能成为渐变的主体跟重组变异的供体。弱毒疫苗H120对ck/CH/L（略..）NM/091017分别株动物保护实验表明,免疫鸡群无IB发病症状,非免疫鸡群的发病率为100%,逝世亡率为10%。剖检发病鸡、逝世亡鸡的病理变更表示为气管潮红、出血,有卡他性粘液,盲肠扁桃体出血,未见肾脏肿大跟尿酸盐沉积等“肾型”IBV的典范病变。用间接ELISA方法对采集的鸡群血清样品进行IBV抗体检测,从免疫后第九天在免疫鸡群的血清样品中检测到抗体,90%血清为阳性。免疫后20天用分别株ck/CH/LNM/091017进行攻毒实验。攻毒后3天,免疫鸡群100%能检测到抗体。非免疫鸡群在攻毒后第9天,血清中IBV抗体检测全部为阳性。攻毒后5天,每组随机扑杀5只鸡,采集组织器官,用RT-PCR方法进行病毒检测,H120免疫ck/CH/LNM/091017攻毒组鸡群的气管、盲肠扁桃体跟腺胃病毒检出率分辨为60%、60%、20%,肾脏跟肺脏均未检测到病毒;ck/CH/L（本文此处忽略..）NM/091017攻毒组鸡群的气管跟腺胃100%检出病毒,肾脏、肺跟盲肠扁桃体病毒检出率分辨为20%、20%、60%。这些数据阐明H120弱毒疫苗对雏鸡肾脏能提供较好的免疫保护,但对ck/CH/LNM/091017分别株不能提供完全保护作用。

以上为本篇毕业论文范文鸡感染性支气管炎病毒ck/CH/LNM/091017株全基因组序列分析及弱毒的介绍部分。

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