幽门螺杆菌cagA基因3’端序列多态性及其临床意义

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幽门螺杆菌cagA基因3’端序列多态性及其临床意义

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毕业论文范文题目：幽门螺杆菌cagA基因3’端序列多态性及其临床意义，论文范文关键词：幽门螺杆菌cagA基因3’端序列多态性及其临床意义
幽门螺杆菌cagA基因3’端序列多态性及其临床意义毕业论文范文介绍开始：
【论文摘要】：第一部分不同胃十二指肠疾病患者幽门螺杆菌cagA基因3'端序列特征目的比较不同胃十二指肠疾病患者临床分离幽门螺杆菌(H.pylori)cagA基因3'端序列特征,探讨其与临床疾病的关系。方法从不同胃十二指肠疾病患者胃黏膜活检组织中分离培养H.pylori41株,其中慢性浅表性胃炎(CSG)13株、十二指肠溃疡(DU)13株和胃癌(GC)15株,通过PCR扩增其cagA基因3'端DNA片段,用自动测序仪(ABI3730)进行双向测序,运用EBI(EuropeanBioinformaticsInstitute)的Transeq程序推测其相应氨基酸序列,及VectorNTIadvance10软件进行多序列比对和相似性分析,比较其序列特征及与胃十二指肠疾病的相关性。结果(1)41株H.pylori菌株中36株(87.80%)cagA基因阳性,其cagA阳性率在DU、GC组均为100%,高于CSG组(61.5%,P＜0.05)。(2)36条cagA基因3'端PCR扩增产物大小为615～664bp,碱基、氨基酸序列中存在大量碱基、氨基酸的插入、缺失、替换和重复;碱基序列之间相同碱基百分比为19.7%,氨基酸序列之间相同氨基酸百分比为36.3%,其相似性较低。(3)根据cagA基因3'端氨基酸序列所含的与SHP-2结合序列不同,可将（略..）其分成两种序列类型,即东亚型(25条,69.4%)和西方型(11条,30.6%);两者均含3个EPIYA(R1)模体,其后分别紧跟3种氨基酸序列,分别命名为R2、R3、R4;东亚型和西方型分别具有不同的R3、R4序列。25条东亚型序列相同碱基、氨基酸百分比分别为30.7%与59.6%,11条西方型序列分别为38.6%与73.1%,均有较高的相似性。(4)不同胃十二指肠疾病患者cagA基因3'端碱基、氨基酸序列亦有较高的相似性,其中CSG组相同碱基及氨基酸百分比分别为70.7%、54%,DU组分别为30.8%、48.4%,GC组分别为22.3%、43.2%,各组间相似性差异无统计学意义(P＞0.05)。东亚型cagA阳性菌株在DU组(92.31%)和GC组(80%)的分布显著高于CSG组(12.5%,P＜0.05)。结论(1)H.pylori菌株cagA基因阳性率高,cagA阳性菌株与十二指肠溃疡和胃癌关系密切。(2)cagA基因3'端碱基、氨基酸序列之间相似性较低,存在大量碱基、氨基酸的插入、缺失、替换和重复。(3)cagA基因3'端氨基酸序列可分为东亚型和西方型两种类型,分别具有不同的R3、R4氨基酸序列,两型cagA基因3'端相似性均较高。(4)不同胃十二指肠疾病患者cagA基因3'端序列亦有较高相似性,东亚型cagA阳性菌株与GC及DU关系更密切。第二部分幽门螺杆菌cagA基因3'端序（此处忽略..）列多态性及其临床意义目的探讨幽门螺杆菌(H.pylori)cagA基因3'端多态性及其与地域和临床疾病的相关性。方法从NCBI网络数据库搜索到H.pyloricagA基因全序列95条,cagA基因3'端碱基、氨基酸序列共387条,并从临床分离41株(分别为CSG13株、DU13株和GC15株)H.pylori中检测到cagA基因3'端序列36条;用VectorNTIadvance10软件对临床检测的36条及已知疾病背景的256条网络数据库cagA基因3'端序列进行多序列比对和相似性分析;用ClustalX(version3.5)、Phylip(version3.5)、Treeview(version1.61)软件对91条cagA全序列进行系统发育分析;综合分析cagA基因3'端序列多态性及其与地域、临床疾病的相关性。结果(1)91条cagA基因全长氨基酸序列之间相同氨基酸百分比为27%,相似性较低;其3'端序列之间差异明显,存在大量氨基酸的插入、缺失、替换外和重复,而5'端序列相对保守。(2)cagA基因全长序列系统发育分析结果表明,东方、西方来源菌株聚类均较近。(3)292条已知疾病背景的cagA基因3'端氨基酸序列中含有六种重复序列,分别命名为C1,C2,C3,C4,C5,C6;其中C3,C4,C6根据（略..）其氨基酸组成不同可分为两种类型,即东亚型(Cn_东)和西方型(Cn_西)。其中239条(81.86%)cagA基因3'端氨基酸序列基本结构为C1-C2-C1-C3_东/C3_西-C4_东/C_西-C5-C1-C6_东/C6_西;另53条(18.14%)cazA基因3'端氨基酸序列长度较长,具有不同的重复序列数目及组合方式,根据其重复序列数目及组合方式不同,可将其分为10型,其中1、7、9、10型仅存在于西方来源菌株,2、3、5、8型仅存在于东方来源菌株,4、6型为东西方来源菌株共有。(4)＞4个EPIYA模体的菌株检出率在萎缩性胃炎组(11.90%)与消化性溃疡组(1.09%)比较差异有统计学意义(P＜0.05),且含有4个以上EPIYA模体的菌株87.5%是在萎缩性胃炎及胃癌中检出。含多个EPIYA-C/D位点的菌株在胃癌患者中的检出率(13.04%)显著高于消化性溃疡患者(4.35%,P＜0.05)。C4数目=3时,GC组(10.14%)与PU组(1.09%)比较差异有统计学意义(P＜0.05),其余重复序列数目在不同胃十二指肠疾病中无统计学意义(P＞0.05)。第6型菌株在胃癌患者中的检出率(11.59%)显著高于消化性溃疡患者(2.17%,P＜0.05)。结论(1)H.pylori菌株cagA基因3'端多态性明显,其差异主要由重复序列的种类、数目和组合方式造成。(2)＞4个EPIYA模体的CagA~+H.pylori菌株可能与萎（文章此处忽略..）缩性胃炎及胃癌有关。(3)含多个EPIYA-C/D位点的Cag~+H.pvlori及第6型CagA~+H.pylori可能与胃癌有关。

以上为本篇毕业论文范文幽门螺杆菌cagA基因3’端序列多态性及其临床意义的介绍部分。

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