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耐辐射异样球菌冷激蛋白的功能鉴定及转录组分析

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毕业论文范文题目:耐辐射异样球菌冷激蛋白的功能鉴定及转录组分析,论文范文关键词:耐辐射异样球菌冷激蛋白的功能鉴定及转录组分析
耐辐射异样球菌冷激蛋白的功能鉴定及转录组分析毕业论文范文介绍开始:
【论文摘要】:冷激蛋白(coldshockprotein,Csp)通常在冷环境下大量合成,广泛存在于动物、动物跟真细菌中。这类蛋白含有结合RNA跟ssDNA的特异冷激构造域,存在RNA分子伴侣或转录加强子的功能,在生物冷胁迫适应反应中起侧重要的调节作用。耐辐射异样球菌(Deinococcusradiodurans)R1含有1个csp-like基因,其渐变导致细胞对电离辐射敏感,但该基因是否存在冷激蛋白功能尚不明白。本论文通过基因渐变、Biolog技巧跟转录组学分析等对csp-like基因的功能及其调节作用进行了深刻研究,获得如下研究进展:csp(略..)-like基因编码一个10kDa的蛋白,包含86个氨基酸残基。序列分析发明,它与Bacillussubtilis的CspB一致性为50%,含有结合RNA跟ssDNA的特异冷激构造域。实时定量PCR分析显示,csp-like基因15℃冷激2h上调1.87倍,其表白存在冷激引诱特点。△_(csp)渐变株较野生型R1菌株在最适温度时成长迟缓,15℃低温成长停止。研究成果表明,该基因产物是一个典范的冷激蛋白。Biolog分析发明,△_(csp)渐变株较野生型R1菌株的碳源利用程度明显改变,csp缺失造成细胞对葡萄糖等8种碳源利用明显降落,3种碳源利用进步。凝胶阻滞实验成果(此处忽略..)表明,D.radioduransCsp结合富含胸腺嘧啶的ssDNA,也结合Y-box(ATTGG)序列或其反向互补序列,结合序列分析揣测,Csp可能通过结合其启动子上游Y-box反向互补序列加强本身表白。为了进一步研究csp基因对细胞代谢的调控作用,本论文发展了畸形成长前提下野生型R1菌株跟△_(csp)渐变株的转录组学分析。成果表明,csp渐变导致466个基因表白上调,322个基因表白下调,表白差别基因产物与细胞壁/细胞膜/细胞包膜生物合成、翻译/核糖体构造跟生物合成、复制重组跟修复、信号转导机制、能量产生跟转换、氨基酸运输跟代谢、脂类运(文章此处忽略..)输跟代谢以及次级代谢产物的合成运输跟分解代谢等有关。实时定量验证了该成果。其中,类胡萝卜素合成相干基因整体表白加强,其合成关键基因crtI上调2.8倍。细胞状况察看跟色素含量测定发明csp渐变株培养物及菌落色彩加深,胞内及胞外类胡萝卜素含量明显增加,表明csp基因参加了细胞色素合成的调控。ddrB、ddrI、recA、pprA跟irrE等DNA应答反应跟伤害修复蛋白多数被引诱表白,氧化抗性蛋白基因表白下调,揣测csp导致氧化抗性蛋白降落是造成渐变株对UV辐射敏感的重要起因。肽聚糖合成相干基因跟细胞包膜S层蛋白基因表白上调,(文章此处忽略..)细胞超微构造的电子显微镜察看显示,渐变株细胞壁最外层物质增多呈泡状溢出甚至脱落;ABC转运子相干基因的表白明显变更,显影质谱分析显示,渐变株细胞多肽或脂多肽类物质分布改变,表明csp影响了细胞包膜的畸形状况建成跟物质运输。本研究表明,耐辐射异样球菌冷激蛋白Csp通过直接或间接的调控作用,影响了细胞的多种生理胁迫反应,包含细胞的抗氧化保护、DNA伤害修复及色素合成等过程,为进一步揭示耐辐射异样球菌极其环境的适应机制奠定了实际基本。


以上为本篇毕业论文范文耐辐射异样球菌冷激蛋白的功能鉴定及转录组分析的介绍部分。
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